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达伯吉亚物种的完整叶绿体基因组序列的表征及其系统发育意义

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2019年12月31日

Yun Song,Yongjiang Zhang,Jin Xu,Weimin Li&Mingfu Li

科学报告第9卷,文章编号:20401(2019)

达伯吉亚物种的完整叶绿体基因组序列的表征及其系统发育意义

抽象的

Pantropical Plant Genus达伯吉亚大约有250种,其中大多数具有很高的经济和生态价值。但是,由于非法伐木和木材贸易,这些物种受到最大威胁。执行保护立法并确保有效保护达伯吉亚物种,必须准确验证木材的身份。为了快速准确地识别达伯吉亚物种和系统发育关系的评估,非常需要为这些物种开发更有效的DNA条形码。在这项研究中,我们测序并比较了达伯吉亚9种的叶绿体基因组。我们发现这些叶绿体基因组在基因组大小,结构和基因含量方面得到了保守,并显示出低序列差异。我们确定了八个突变热点,分别是六个基因间间隔区(TRNL-TRNT,ATPA-TRNG,RPS16-ACCD,PETG-PSAJ,NDHF-TRNL和NDHG-NDHI)和两个编码区(YCF1A和YCF1A和YCF1B),AS YCF1A和YCF1B)DNA条形码达伯吉亚。基于整个叶绿体基因组数据的系统发育分析提供了最佳分辨率达伯吉亚,以及对豆科的系统发育分析表明,达伯吉亚是阿拉奇的姐姐。根据叶绿体基因组的比较,我们确定了一组高度可变的标记,可以开发为特定的DNA条形码。

更多信息:https://www.nature.com/articles/s41598-019-56727-x

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