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CRISPR屏幕测序欧宝体育官网网址

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CRISPR屏幕测序介绍欧宝体育官网网址

CRISPR屏幕是重要分子靶标的高通量筛选方法。有效的CRISPR屏幕从一个设计精心设计的SGRNA库,针对感兴趣的基因或基因。SGRNA基于序列设计,然后合成,然后克隆到载体或转录成RNA用于在细胞系统中转染。然后进行广泛使用的阳性或阴性选择的筛网。将在细胞物理分离到两个或更多个群体后进行PCR扩增和大规模平行测序。欧宝体育官网网址在数据分析之后,将确定SGRNA和目标基因。

CRISPR屏幕技术用于高通量筛选,可以产生大量基因突变细胞,并且可以在不同外部环境的刺激下筛选突变细胞库。通过高通量测序和生物信息学分析,可以进一步确定表欧宝体育官网网址型和基因型之间的关系。此外,基于CRISPR / CAS9库的高通量筛选还克服了低转染效率的问题,并且仅在RNA干扰筛选技术面临的mRNA水平下抑制基因表达的能力。它在精密医学时代具有良好的科学价值和广泛的应用空间。

为解决研究社区的新兴需求,CD基因组学通过利用基于扩增子的下一代测序,开发了一种实惠,可靠,高通量的CRISPR筛选测序策略。欧宝体育官网网址我们的CRISPR屏幕测序服务可以为欧宝体育官网网址您提供有关SGRNA和有针对性基因分析和功能性浓缩分析的直接和详细信息,以帮助研究人员以高吞吐量的方式研究基因。

CRISPR筛选概述
图1. CRISPR筛选概述

CRISPR屏幕测序工作流程欧宝体育官网网址

我们经验丰富的专家团队在每次程序后执行质量管理,以确保全面和准确的结果。我们的CRISPR屏幕测序工作流程如欧宝体育官网网址下所述,包括DNA分离,PCR实验,测序和生物信息学分析。我们的CRISPR筛选测序还可以帮助欧宝体育官网网址研究人员确定哪些基因敲除产生与屏幕相关的表型。

我们的CRISPR屏幕测序的工作流程欧宝体育官网网址
图2.我们的CRISPR屏幕测序的工作流程欧宝体育官网网址

服务规格

样品要求和准备

  • 样品类型:阳性/阴性选择后的细胞或DNA样品
  • DNA样品:〜1.5μg(浓度≥30ng/μl; OD260 / 280 = 1.8〜2.0)
  • 细胞样品:5×106.细胞
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  • Illumina Hiseq平台
  • 配对端150 BP或300 BP
  • 测序质量指标分析欧宝体育官网网址
生物信息学分析

我们提供定制的生物信息学分析,包括:

  • 原始数据QC
  • 参考对齐方式
  • SGRNA丰富分析
  • SGRNA丰富的差异分析

送货

  • 原始数据(FASTQ)
  • 数据分析报告

我们的优势

  • 广泛的多路复用灵活性和高通量测序,可以用于量化和比较SGRNA的频率欧宝体育官网网址
  • 具有成本效益,高敏感的检测水平无偏差
  • 不需要费力且耗时的克隆步骤
  • 专业的博士学位的支持。级科学家

CD基因组学能够以相当便宜的价格,帮助您确定SGRNA和有针对性的感兴趣的基因和深度测序。欧宝体育官网网址我们可以同时序列数百个样本。将用魔法工具分析SGRNA的丰富和组之间的差异。如果您有其他要求或问题,请随时与我们联系。

参考:

  1. 艾拉H,。遗传筛和使用CRISPRCAS9技术的功能基因组学。FEBS Journal.,2015,1383-1393。
  2. 周y,。用于人体细胞功能基因组学的CRISPR / CAS9库的高通量筛选[J]。自然,2014,509(2):487-491。
*仅供研究使用。不用于诊断过程。
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