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完全质粒DNA测序欧宝体育官网网址

书签和分享

CD基因组学提供完整的质粒DNA测序服务,我们可以进行改进的生物信息学管道欧宝体育官网网址德诺维组装无需参考。

的简介完全的质粒DNAS.等等

质粒被认为是存在超染色体的移动遗传元件,并且偶尔携带载体基因,其在其生态学利基中赋予其宿主的优势。因此,他们认为通过横向将基因和特征引入微生物基因组中在微生物社区中发挥重要的进化作用。质粒是快速适应细菌种群以改变环境条件的重要载体。质粒载体产生的遗传变异群体中的侵蚀性对环境变化的鲁棒性。质粒介导的基因转移不仅在动员和传播抗生素抗性基因的过程中也起着重要作用,而且在病原体的降解途径和致病性决定簇的扩散中起着重要作用。

尽管重要的是,技术障碍仍然限制了质粒研究。质粒DNA测序正在迅速成欧宝体育官网网址为增加我们对质粒遗传多样性和进化史的理解的标准方法。它不仅有助于定义在这些质粒的演变过程中发生的分子事件,而且还可以让我们更完整地概述在质粒上编码的巨大辅助基因的收集。比较质粒序列分析已经为质粒的演变和相关性,模块化结构和热斑的存在而提供了洞察的见解,用于插入辅助基因。

主要特点和优点

  • 完全验证已知质粒
  • 未知质粒的全长测序欧宝体育官网网址
  • 质粒基因组的完全表征
  • 不需要参考序列
  • 准确组装
  • 具有成本效益的高吞吐量排序欧宝体育官网网址
  • 高质量数据和快速转机

项目工作流程

欧宝体育官网网址测序策略:

Illumina平台,图书馆尺寸:400-500 BP,PE 250,100x
PACBIO平台:图书馆尺寸:4 K,100x

数据分析

  • 数据质量控制
  • 高质量数据采集
  • 基因组德诺维集会
  • 检测质粒特异性序列
  • …和更多

分析管道

CD基因组学的质粒测序服务利用Illumin欧宝体育官网网址a平台进行质粒验证的力量,并开发了使用的低成本高通量方法,用于完成更大的质粒测序PacBio SMRT技术。我们很高兴地利用我们丰富的经验和先进的平台来提供最好的服务和最合格的产品,以满足客户的每种需求。

*仅供研究使用。不用于诊断过程。
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