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核糖体分析(Ribo-SEQ)

书签和分享

强调在翻译水平下测量基因表达的值导致核糖体 - 分析技术的发展。核糖体分析是用于确定核糖体读取的精确mRNA区域的直接方法,以检查与翻译机械相关的转录物。核糖体谱分析提供蛋白质生产的细胞快照,潜力可以告知几乎所有生物和临床研究领域。与传统的RNA-SEQ实验相比,核糖体分析专门设计用于测量mRNA涉及活动的翻译。

CD基因组学提供了一种核糖体 - 分析策略,其基于核糖体保护的mRNA片段的深度测序,并使得与亚CORTON分辨率的基因组调查进行翻译。欧宝体育官网网址使用核酸酶消化,可以通过分析mRNA模板的受保护〜30nt区域来精确确定核糖体位置和翻译消息。

SNP微阵列

图1核糖体保护的mRNA

核糖体分析的应用

  • 受核糖体保护的mRNA的序列。
  • 用测序的活性mRNA翻译研究。欧宝体育官网网址
  • 蛋白质丰富的预测。
  • 识别翻译开始网站
  • 转录控制和转录后调查调查。

核糖体分析工作流程

使用核酸酶消化以分离核酸脲核糖体,可以通过在翻译期间分析受保护的30个核苷酸来精确确定翻译的消息。

SNP微阵列

样本要求

  • 冷冻细胞或组织样品

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  • Illumina高吞吐量序列仪
  • 灵活的服务选项,单端或配对结束排序,可选根据研究目标读取编号。欧宝体育官网网址

数据分析

  • 原始数据QC和3'-Adapter修剪
  • 读对齐
  • 基因表达分析
  • 替代翻译启动网站识别
  • 途径分析
*仅供研究使用。不用于诊断过程。
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