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全长16S / 18S /其Axplicon测序欧宝体育官网网址

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在广泛的测序经验方面,CD Genomics很自豪能够以最优质和最具竞争力的价格欧宝体育官网网址为我们的客户提供全长16秒/ 18秒/ rRNA服务。

的简介全长16S / 18S /其Axplicon测序欧宝体育官网网址

16S rRNA基因在不同种类的细菌和古痤疮之间高度保守,其含有九个高变区域(V1-V9)范围为约30〜100碱基对,它们在细菌之间急剧变化。高度保守的地区允许研究人员设计入门对,以准确且可靠地放大其选择的16S可高变区域,以实现各种细菌社区的鉴定或表征。

类似于细菌16s rRNA基因,真核18s rRNA基因具有保守和可变地区。18S RRNA基因序列及其相关的转录间隔物(内部转录间隔物;其)用于分类真菌和真核生物。

基于测序技术的开发,欧宝体育官网网址16S / 18S /其RRNA基因测序欧宝体育官网网址是研究细菌和真菌分类和分子系统发生的最佳工具。通过利用PACBIO SMRT LONG读取测序欧宝体育官网网址技术,CD基因组学可以提供全长16s / 18s /它的rRNA测序服务,以更好地帮助您的研究。欧宝体育官网网址

特别是对于16S rRNA测序,PACBIO S欧宝体育官网网址MRT序列的平均读取长度为10〜18 k,其可以覆盖16s rRNA的所有可变区(总长度约为1,500bp),并且在QV30的SMRT细胞中产生超过250,000次读数解决16S rDNA序列。此外,循环共识测序(CCS)为全长16S rDNA产生高分子分子欧宝体育官网网址共有精度,以准确到“物种”分类和鉴定。

此外,通过全长测序进行微生物组分析,18S rRNA(总长度为1,500-2,000bp)及其(约400-900bp)也能够进行。欧宝体育官网网址

项目工作流程

样品要求:

gdna≥100ng
PCR产物≥400ng

欧宝体育官网网址测序策略:

PacBio续集平台,2000〜20000 CCS读取/每个样本

数据分析

  • OTUS聚类和过滤
  • Otus分析和物种注释
  • PCA,Venn图。将基于OTU丰度生成等级曲线
  • Alpha多样性,Beta多样性,Meta分析
  • 多变体统计分析
  • ......(根据要求)

生物信息学工作流程

长读取序列使物种级别欧宝体育官网网址分辨率和驱动功能洞察的功能见解,具有全长16秒/ 18秒/ 18秒/ rRNA。CD基因组学提供产品以支持全长16S / 18S / rRNA测序服务,从样品准备和图书馆构建到数据分析。欧宝体育官网网址可应要求提供定制服务。请联系我们获取更多信息。

图1.与短读16S rRNA和霰弹枪组装结果相比,模拟微生物群落的全长16S rRNA序列提供了更准确的社区概况

*仅供研究使用。不用于诊断过程。
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