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长读测序欧宝体育官网网址

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CD基因组学提供了尖端技术和长读测序的生物信息学分析服务,包括欧宝体育官网网址PACBIO SMRT测欧宝体育官网网址序纳米孔测序欧宝体育官网网址。我们为人,动物,植物和微生物研究提供准确且经济高效的测序解决方案。欧宝体育官网网址

长读测序的引入欧宝体育官网网址

长读取测序,也称为第欧宝体育官网网址三代测序,是一组蓬勃发展的DNA测序技术,可消除对传统测序技术DNA切割和扩增的需要,并允许同时检测高达100,000碱基对的长DNA序列。科学家已经实现了人类基因组结构变体的重要性。其中一些是插入变体,超过许多测序技术的读取长度;欧宝体育官网网址有些是重复的区域,使序列对准困难;有些是富含GC的地区,这通常会通过短读取测序方法研究结构变体的许多不便。欧宝体育官网网址

近年来,可以出现可以检测到长读序列的新型技术,为研究人员提供了新的基因组分析的新策略和工具。其中,最具代表性和广泛使用的是PACBIO SMRT测序和纳米孔测序。欧宝体育官网网址长读取的测序技术可以欧宝体育官网网址产生很长的读取,在下一代测序中是不可能的。

PACBIO推出了单分子实时测序(SMR欧宝体育官网网址T)的测序平台,其使用具有许多零模式波导的定制流动单元来序列在实时(ZMW)中序列单个分子。聚合酶连接到井底并使DNA链通过ZMW。使用SMRT测序,可以实现与特异性DNA模板分子合成的荧光标记的核苷酸的实时成像。欧宝体育官网网址当框架和聚合酶分开时,排序反应完成。欧宝体育官网网址

纳米孔技术的核心元素分为从纳米孔的跨膜通道形成,允许离子电流通过并测量电流变化。当DNA或RNA等分子通过纳米孔时,它们会导致电流中断。关于电流变化的信息可用于识别分子。它直接序列整个DNA / RNA分子。

主要特点和优点

  • 长平均读取长度和高共识准确性
  • 改进了重复序列和拷贝数变化的准确性
  • 更准确地检测大量突变
  • 长读测序中DNA提取方案的优化欧宝体育官网网址
  • 与基因组和转录组分析相容
  • 快速且价格合理

工作流程

服务规格

样本类型

  • GDNA,总RNA,组织,细胞
欧宝体育官网网址测序策略

  • ONT平台,图书馆:8K,2G / Per Sample
  • Pacbio平台,20 k图书馆
应用

  • 基因功能:专注于携带特定功能的样本,以揭示不同功能的主要原因
  • 基因结构:替代剪接,APA,融合基因,SSR,CDS预测,TSS / TES识别等
  • 全长量化:找到全面且有效的差异基因并鉴定功能基因
  • 表观组织:直接全长基因组和转录组测序可以检测基础修改欧宝体育官网网址

CD基因组学提供全面的长读测序服务包,包括样品制备,图书馆施工,SMRT测序和/或纳米孔测序以欧宝体育官网网址及生物信息学分析。我们可以根据您的研究兴趣定制该管道。如果您有其他要求或问题,请随时与我们联系。

*仅供研究使用。不用于诊断过程。
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