单细胞测序欧宝体育官网网址

CD基因组学专有Genseq^TM值技术提供全面的单细胞排序服务。欧宝体育官网网址单细胞中的这些全局基因表达模式已经有显着的细胞生物学。

引入单细胞测序欧宝体育官网网址

单细胞测序是用于在单细胞欧宝体育官网网址水平下放大和测序DNA / RNA的新技术。该原理是使用MDA或MALBAC有效地从分离的单细胞中释放DNA / RNA，然后进行深序。欧宝体育官网网址强大的生物信息学分析使我们能够获得细胞 - 细胞异质性，细胞群差和细胞演化的信息。单细胞基因组学将有助于揭示细胞谱系关系;单细胞转录组织将取代基于标记物的细胞类型的粗糙概念;和单细胞表观囊组和蛋白质组学将允许分析各种细胞的功能状态。在CD基因组学中，我们致力于提供高质量单细胞RNA测序欧宝体育官网网址那单细胞DNA测序欧宝体育官网网址那单细胞DNA甲基化测序欧宝体育官网网址和10x基因组学单细胞测序欧宝体育官网网址。

欧宝官网app苹果下载应用程序：

• 分析稀缺临床样本
• 测量肿瘤内异质性和指导化疗
• 肿瘤进展期间癌细胞演变分析
• 预植入遗传诊断（PGD）

CD基因组学的单细胞试剂盒产生适用于使用寡核苷酸ACGH或QPCR的拷贝数变异（CNV）分析的扩增DNA片段;SNP基因分型，突变检测和测序。欧宝体育官网网址

单细胞测序的优点欧宝体育官网网址

• 完全的：整个细胞整体转录组分析的端到端工作流程。
• 最高吞吐量：每次运行高达96个单细胞的前所未有的并行处理。
• 最容易使用：总容易发生的时间不到三个小时，直接从单细胞工作，没有RNA碎片和纯化步骤。
• 合理的：八分十分之一图书馆准备系统的成本。

单细胞排序工作流程欧宝体育官网网址

流式细胞术和激光捕获微散射的出现使得可以捕获单个细胞，并且单细胞的DNA或RNA被扩增用于单细胞测序。欧宝体育官网网址单细胞排序的一般工作流程如下。欧宝体育官网网址

服务规格

	样品要求和准备 DNA量≥100pg RNA量≥50pg 所有样品都验证了纯度和数量
	欧宝体育官网网址 nextseq 500序列仪那Illumina Hiseq 2500.那miseq序列机 覆盖深度≥100x 超过80％的基地，≥Q30质量分数
	生物信息学分析 原始数据质量控制 测序深度和覆盖的统计欧宝体育官网网址 SNP / Indel / SV / CNV呼叫 注释和统计数据 途径浓缩分析 ob体育娱乐人口遗传学分析 更多数据挖掘您的要求

可交付成果

• 原始排序数据欧宝体育官网网址
• 实验结果
• 数据分析报告
• 用于您的写作单细胞测序中的详细信息（定制）欧宝体育官网网址

CD基因组学的单细胞测序会议侧重于组织和器官功能的细欧宝体育官网网址胞变异之间的链接，进一步阐明了疾病的起源。如果您有其他要求或问题，请随时与我们联系。

单细胞基因组扩增的原理，优缺点。

一世。MDA（多个位移放大）

由Laskin等人发明。2001年。使用随机六种聚合物引物和φ29DNA聚合酶反应，具有强的链置置换特性，并且可以在等温条件下扩增50〜100kb的DNA片段。同时，由于其3'-5'外切核酸酶活性和校对活性，φ29DNA聚合酶具有高保真度。MDA方法具有更高的基因组覆盖范围。

II。MALBAC（多次退火和基于环路的扩增循环）

Quasilinear扩增过程降低了指数放大的序列偏好。含有27bp和3'常见序列的扩增引物的5'是8bp的随机序列，其可以在15〜20c的低温下与模板组合，然后在Quasilinear扩增后扩增这些环形扩增子8〜12周期。

MALBAC方法的优点是序列偏好是不同细胞之间的可重复的。由于其更好的扩增均匀性，其数据更适合于CNV分析。MALBAC的弱点是它使用的聚合酶的保真度不如Φ29DNA聚合酶一样好，因此在检测SNV时MALBAC将具有更大的阳性。另外，由于其可重复性序列偏好，基因组中低扩增区域有时在扩增过程中丢失。

2.单细胞测序的采样要求。欧宝体育官网网址

MDA扩增：样品体积不能超过2μL。公司供应含有2μLPBS的PCR管。MALBAC扩增：样品体积不能超过1μL。确保样品没有加入²⁺，mg.²⁺，该公司提供含有4μL裂解物的管。样品应尽可能独立地分离，避免细胞粘附和细胞片段，影响放大的质量。

膜肾病患者外周血单核细胞中组蛋白H3K9三甲基化的芯片SEQ分析

杂志：巴西医学与生物学研究
发布时间：2013年12月12日

背景

膜状肾病（Mn），其特征在于，通过肾小球基底膜和耻骨上的衍射增厚的存在，是成人特发性肾病综合征的最常见原因，每年发病率为5-10百万。许多研究证实了几种实验见解对人Mn发病机制的相关性，但MN的特定生物标志物尚未完全阐明。

结果

在该研究中，作者使用染色质免疫沉淀，然后使用高通量测序（芯片-SEQ），分析来自10mN患者和10个健康受试者的外周血单核细胞中甲基化组蛋白（H3K9ME3）的变化。欧宝体育官网网址与正常对照相比，MN患者中有108个基因具有显着不同的表达。在MN患者中，在75 H3K9ME3基因中看到的活性显着增加，与健康受试者相比，33中观察到的活性下降。选择5个阳性基因，Digeorge综合征临界区域基因6（DGCR6），分类Nexin 16（SNX16），接触4（CNTN4），含有3（BiRC 3）的杆状病毒IAP重复，含有2（Birc2）的杆状病毒IAP重复，。MN患者中有H3K9ME3的改变。

表1芯片-SEQ和对准结果。
对齐的读数：读数的数量是指参考基因组;仅对齐读数：读数的数量仅指参考基因组;％对齐：对齐读/总读数;％仅限：对齐只读/总读取。

图1.膜肾病患者H3K9ME3的芯片-SEQ峰值分布（距离）。

图2.相对于带注释基因的峰的基因组分布。

图3.通过基因本体学（GO）分析（Amigo 1.8）分布峰相对基因的分布。横向轴表示GO术语。左纵轴表示相关基因的比例。右纵轴表示相关基因的数量。

表2.来自膜肾病患者H3K9ME3的基本信息。
S：C + G;R：A + G;K：T + G;Y：C + T;M：A + C;v：A + C + G.
图4.芯片-SEQ图案标志。横轴表示图案的基因座。垂直轴的总高度反映了图案的保护。每个碱基的高度表示基座的概率。

表3.通过芯片-SEQ鉴定的膜肾病患者与H3K9ME3改变的选择基因。

总之，作者认为这些结果可能是候选人，以帮助解释MN患者的发病机制。这种新颖的发现表明，H3K9ME3可以是基于表观遗传学的Mn疗法的潜在生物标志物或有希望的靶标。

参考Sui W G，等。膜-SEQ分析组蛋白H3K9三甲基化膜状肾病患者的外周血单核细胞。巴西医学与生物研究杂志，2014,47（1）：42-9。