lncrna测欧宝体育官网网址序

CD基因组学通过结合最新的illumina测序仪器和先进的生物信息学分析，提供高通量和具有成本效益的LNCRNA测序服务。欧宝体育官网网址

LNCRNA测序的引入欧宝体育官网网址

长期非编码RNA（LNCRNA）被定义为具有大于200NT的大小的转录RNA，其不会编码蛋白质。LNCRNA广泛分布于生物体和LNCRNA转录物中，占非编码转录组的主要部分。基于与其他基因相关的转录的位置和方向，LNCRNA可以分为不同的亚型（包括非静脉，非官能，重叠，内肠，双向和加工）。LNCRNA类似于MRNA，因为它们通常是从活性染色质，聚腺苷酸化和封端的。但是，它们并不直接蛋白质合成。

LNCRNA在功能上对生物来说是重要的，而且不仅仅是转录噪声的产物。在哺乳动物和植物中发现了LNCRNA的多数分子函数，包括核小体重新定位，染色质重塑，转录控制和后术治疗。LNCRNA越来越涉及疾病发生，基因组印记和发育调控。基因表达分析和原位杂交研究表明，LNCRNA表达是发育调节的，可以是组织和细胞型特异性，并且可以在空间，时间，或响应于刺激而变化。

下一代测序技术的应用极大地促进了LNCRNA的发现和功能分析。欧宝体育官网网址可以通过库制备，高通量测序和强大的生物信息学分析在单基分辨率下获得LNCRNA序列信息。欧宝体育官网网址通过去除RRNA来构建测序库并保留欧宝体育官网网址LNCRNA和MRNA。LNCRNA-mRNA相互作用分析有助于LNCRNA调节网络的照明。

LNCRNA测序的优点欧宝体育官网网址

• 识别已知和新颖的功能
• 允许跨越宽动态范围的LNCRNA分析
• 探索新型生物标志物和LNCRNA监管网络

lncrna测欧宝体育官网网址序工作流程

下面概述了LNCRNA测序的一般工作流程。欧宝体育官网网址为了构建LNCRNA测序文库，LNCRN欧宝体育官网网址A测序的第一步是耗尽RRNA，然后达到RNA碎片，cDNA合成，衔接子连接，尺寸选择和PCR富集。我们经验丰富的专家团队执行质量管理，以确保有信心和无偏见的结果。

服务规范

	样品要求和准备 样品类型：总RNA没有降解或DNA污染 总RNA的起始量≥2μg 样品浓度≥200ng/μl 样品纯度：OD260 / 280 = 1.8〜2.2 所有RNA样品都验证了纯度和数量
	欧宝体育官网网址 股线特异性文库制备 Illumina Hiseq PE150 ≥10g用于小基因组的数据和大型基因组的≥12g 超过80％的基地，≥Q30质量分数
	生物信息学分析 我们提供定制的生物信息学分析，包括： 原始数据质量控制和长度过滤器 基于参考的映射 预测新的转录物（包括LNCRNA） LNCRNA和MRNA的定量和差异表达分析 LNCRNA系列和LNCRNA功能注释的分类 SNP / Indel呼叫，识别拼接变体 LNCRNA靶预测和LNCRNA-mRNA相互作用分析

分析管道

我们的博士学位生物信息学团队为LNCRNA和MRNA提供全面的分析，可以在单个测序运行中访问LNCRNA和MRNA信息。欧宝体育官网网址我们可以在项目开始时帮助实验设计，并在项目流程的每个阶段提供咨询。

1.什么种类适用于LNCRNA测序研究？欧宝体育官网网址

对于LNCRNA测序研欧宝体育官网网址究，适当的物种需要满足以下要求：（i）真核生物;（ii）至少有支架级参考基因组;（iii）相对完整的基因组注释。

2.为什么在构建LNCRNA测序文库时去除rRNA？欧宝体育官网网址

核糖体RNA（RRNA）是总RNA中最丰富的组分，包含来自动物或人的总RNA样品中的80％至90％的分子。对于有效的转录物检测，在测序之前必须拆下高度丰富的RRNA。欧宝体育官网网址

3.如何预测LNCRNA目标？

已经证明了在生物过程中LNCRNA的潜在功能和LNCRNA靶预测的研究中有效地证明了对蛋白质编码RNA和LNCRNA的共同表达和蛋白质编码RNA和LNCRNA的共同表达的分析。当共定位分析考虑相邻的编码基因时，也可以是LNCRNA靶标，同表达分析认为是具有可能的LNCRNA靶标的共表达的基因，与位置无关。

4. LNCRNA和mRNA之间有什么差异？

LNCRNA类似于MRNA，因为它们通常是从活性染色质，聚腺苷酸化和封端的。但是，它们并不直接蛋白质合成。LNCRNA和mRNA之间的一些差异总结在下表中。

鉴定ISLet的长非编码RNA，有助于2型糖尿病患者的β细胞衰竭

杂志：分子新陈代谢
影响因素：6.799
发表时间：2017年8月23日

抽象的

作者鉴定了大约1500个新的LNCRNA，其中一些在肥胖小鼠中差异表达。两个LNCRNA（βLINC2和β11）在β细胞中高度富集，与肥胖小鼠的体重增加和血肿水平相关，并在糖尿病DB / DB小鼠中改性。此外，β11N3的人原后间的表达在2型糖尿病患者的胰岛中改变，与供体的BMI相关联。在Min6和小鼠胰岛细胞中通过过表达或下调调节两种LNCRNA的水平增加β细胞，但不影响胰岛素分泌。

材料与方法

结果

RNA测序分析欧宝体育官网网址

RNA测欧宝体育官网网址序产生1558个新的LNCRNA，其中一些在肥胖小鼠中差异表达。功能注释显示与蛋白质定位和运输，氧化还原过程以及细胞内运输有关的生物途径的富集。

图1. RNA测序结果概述。欧宝体育官网网址（a）分层聚类。红色表示没有距离和黄色代表更长的距离。ND表示正常饮食，HDR表示高脂饮食响应者。（b）差异表达基因的概述。（c）新型转录物的编码潜力;（d）蛋白质编码基因的大小分布，已知和新的LNCRNA。（e＆f）βlinc2或βlinc3的轨迹架构和同种型。

2.β11C2和β11C3的表达水平

图2.β11C2和β11N3的表达水平在喂养高脂饮食和DB / DB小鼠中的小鼠中的胰岛修饰。

图3.β1110和β11C3的表达与体重，胰岛素血症和C57BL / 6MICE的糖血症的相关性。

图4。体外慢性升高的葡萄糖和棕榈酸在喂养高脂饮食的小鼠中差异表达的两种LNCRNA水平的影响。

图5.来自2型糖尿病供体的胰岛中表达减少。

图6.β11C1和β11N的过表达和下调促进Min6β-细胞的细胞凋亡。（a）用对照载体或质粒转染MIN6细胞，以诱导β11C2或β11CIN3的过度表达。（b）用对照间隙或Gapmer转染细胞以敲βlinc3。（C＆D）是分散的小鼠胰岛细胞中的重复实验。（e）用表达GFP标记的P65的质粒转染MIN6细胞。

结论

本文确定了大量的LNCRNA。其中至少两个可以影响β细胞的存活，并且可能有助于葡糖毒素介导的β细胞和T2D的表现和进展。因此，LNCRNA可以为糖尿病预防和治疗提供理想的靶标。

参考：
Motterle A，Gattesco S，Peyot M L，等。鉴定富含胰岛的长非编码RNA，其含有2型糖尿病患者的β细胞衰竭。分子代谢，2017,6（11）：1407-1418。