细菌RNA测序欧宝体育官网网址

除真核外RNA测欧宝体育官网网址序服务，CD基因组学也致力于提供原核RNA测序服务，通过利用最新技术来推进细菌基因表达谱的需求。欧宝体育官网网址

引入细菌RNA测序欧宝体育官网网址

近年来，cDNA文库的高通量测序（欧宝体育官网网址RNA-SEQ.）已经成为谱分析基因表达的强大技术，发现以前的未毁灭的基因，并以各种细菌种类在绘制转录组结构。随着应用的应用RNA-SEQ.衍生方法，我们可以获得生物学洞察细菌世界，并渴望揭示涉及基因表达，组织和其他功能基因组特征的谜团。细菌转录组和metaTranscriptome.信息对于预测对特异性抗生素的抗性，了解宿主病原体免疫相互作用，量化基因表达的变化以及跟踪疾病进展的信息很重要。

细菌RNA-SEQ与真核RNA-SEQ之间的cDNA文库构建显而易见。细菌RNA-SEQ工作流的第一步是MRNA转录物的选择。利用核心零核糖体RNA还原化学在聚 - 尾部选择，这使得这种方法特别适用于细菌mRNA缺乏聚尾。净化后，将mRNA分成小块，并使用逆转录酶和随机引物复制到第一链cDNA中。通过在第二链标记混合物（SMM）中用DUTP替代DTTP来实现链特异性，然后进行第二链cDNA合成。通过使用股线特异性RNA-SEQ，可以实现对转录组的更完整的理解，这具有识别基因表达的新调控水平。

项目工作流程

样品要求：

1. RNA量：总RNA≥3ug（不降解或DNA污染）
2. RNA纯度：OD260 / 280 = 1.8〜2.2;OD260 /230≥1.8
3. RNA质量：28秒：18s≥1.5，≥7

欧宝体育官网网址测序策略：

Hiseq x Ten.，150 pe，每个样品1〜3克

数据分析

转录组没有参考

• 转录组总组装
• 转录组/ Unigene长度统计
• 转录组函数注释，包括NR，NT，基因本体，Kegg途径，Kog，Swissport，蛋白质家庭
• 差异表达分析
• CD预测解析
• SNP / INDEL分析
• ......（根据要求）

转录组参考

• 转录组总组装
• 转录组/ Unigene长度统计
• 转录组函数注释，包括NR，NT，基因本体，Kegg途径，Kog，Swissport，蛋白质家庭
• 差异表达分析
• CD预测解析
• SNP / INDEL分析
• ......（根据要求）

CD基因组学提供一种快速的一站式细菌RNA测序溶液，从样品的质量控制到综合数据分析。欧宝体育官网网址请联系我们获取更多信息和详细报价。