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单细胞RNA测序欧宝体育官网网址

书签和分享

CD基因组学提供强大的转录组研究服务,以高质量样本的单细胞输入水平,这些全球基因表达模式在单细胞中已经大大提出了高级的细胞生物学。

引入单细胞RNA测序欧宝体育官网网址

细胞是生命的基本单位,每个细胞都是独特的。揭示生物系统中复杂细胞事件的能力对于在发育过程中或疾病进展期间更好地了解细胞贡献至关重要。由混合细胞群组成的样品上单细胞分辨率的基因表达研究允许深入了解C的传递组复杂性。

CD Genomics为图书馆制备和测序,从单个细胞,少量细胞和RNA的超低输入提供最佳工具。欧宝体育官网网址将强大的cDNA合成技术与Illumina下一代测序和分析技术相结合,我们提供最高质量的可靠数据,以研究细胞对细胞转录组异质性欧宝体育官网网址

单细胞RNA测序工作流程欧宝体育官网网址

细胞分选/分区技术的出现,例如流式细胞术和微流体,使得可以捕获单个细胞,并且单细胞的DNA或RNA被扩增单细胞测序欧宝体育官网网址。单细胞RNA测序的一般工作流程下面概述。欧宝体育官网网址

SNP微阵列

技术描述

Fluidigm C1单细胞mRNA工作流程。我们提供的流体C1系统单细胞转录组分析服务以可选的规模。C1可以快速可靠地捕获和处理单个细胞。集成C1单电池MRNA SEQ工作流程的步骤包括捕获细胞的流体电路(IFC),将PolyA + RNA转换为全长cDNA,并进行CDNA的普遍扩增。利用可定制的微流体电路,C1能够通过识别关键细胞群体来生成转录物3'终数计数,全长mRNA测序,DNA测序,表观遗传分析,微RNA表达分析等临界细胞群以产生测序文库。欧宝体育官网网址

SMART-SEQ超低输入RNA用于测序。欧宝体育官网网址智能技术提供全长抄本信息,使转录同种型,基因融合,点突变等的分析。采用该技术的套件使用户能够直接从1-1,000个完整细胞或超低输入总RNA进行cDNA合成高再现性和富含GC的转录物的准确表示。使用此套件产生的全长cDNA库与Illumina平台兼容。

服务规格

样本要求

  • 建议为此程序推荐96孔活细胞悬浮液。
  • 特异性冷冻裂解物中的冷冻细胞也可用作原料。

> 100 pg提取的RNA,OD260 / 280比率在1.8至2.0之间

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灵活的服务选项包括Hiseq x Ten.Hiseq 4000.

生物信息学分析

  • 原始数据质量控制
  • 测序深度和覆盖的统计欧宝体育官网网址
  • SNP / Indel / SV / CNV呼叫
  • 注释和统计数据
  • 途径浓缩分析
  • ob体育娱乐人口遗传学分析
  • 更多数据挖掘您的要求

可交付成果

  • 原始排序数据欧宝体育官网网址
  • 实验结果
  • 数据分析报告
  • 用于您的写作单细胞测序中的详细信息(定制)欧宝体育官网网址

CD基因组学的单细胞测序会议侧重于组织和器官功能的细欧宝体育官网网址胞变异之间的链接,进一步阐明了疾病的起源。如果您有其他要求或问题,请随时与我们联系。

参考

吴,ar。单细胞RNA测序方法的定量评估。欧宝体育官网网址自然方法。2014年1月;11(1):41-46。

2. Picelli,S。使用Smart-SEQ2的单细胞全长RNA-SEQ。自然协议。2014年1月; 9(1):171-81。

*仅供研究使用。不用于诊断过程。
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