PAN基因组

PAN基因组简介

PAN基因组是疏水内的所有菌株的整组基因，包括核心基因组和可变/辅助/可分配基因组。核心基因组由所有菌株中存在的序列组成，并且通常与物种的生物功能和主要表型特征有关，反映了物种的稳定性;可变/附带/可分配基因组由仅存在于单个菌株或部分菌株中的序列组成，该序列与物种对特定环境的适应性或独特的生物学特征有关，反映了物种的特征。

PAN基因组测序使用高欧宝体育官网网址通量测序和生物信息分析来执行人物/亚种/谱系的物种的文库构建和深入测序，然后分别组装并构建PAN基因组图，丰富物种的遗传信息并研究其重要信息生物问题。

图1.平移基因组的组成

PAN基因组的优点和特征

• 通过测序亚种和个人来丰富物种的基因组信息欧宝体育官网网址
• 快速发现基于可变基因组的研究的重要性状相关的基因或结构变化
• 从独特基因序列的角度研究种类内的差异
• 人口小，成本和时间效率

PAN基因组工作流程

分析管道

常问问题

• PAN基因组测序需要多少样品？欧宝体育官网网址

至少需要2个个人或亚种。

• 如果需要参考基因组？

没有参考基因组是合适的。