MERIP测欧宝体育官网网址序（M6A分析）

使用单次测序的引入欧宝体育官网网址

RNA受到表观遗传修饰的影响，对可以影响许多生物过程的RNA的翻译后修饰已经获得了作为动态表观遗传标记的接受。N6-甲基腺苷（M6A）是信使RNA中最常见和丰富的修饰，并与MRNA命运的不同影响有关。对其分布和功能的深入研究表明，M6a通常在止挡密码子附近，而且在编码序列，3'UTR和MRNA的5'UTR中。

CD基因组学通过甲基化的RNA免疫沉淀测序（MERIP-SEQ）提供了M6A中M6A的位置的转录物组分析。欧宝体育官网网址Meripseq使用特异性地检测和表征RNA中N6-甲基腺苷（M6A）的抗体。由于MRNA的3'URR在mRNA稳定性，定位和翻译中起重要作用，并且可能影响RNA调节蛋白对这些区域的结合，该区域中的M6A富集表明M6A可能影响RNA代谢和基因表达。抑制涉及RNA甲基化的酶也为该改性的潜在生物学作用提供了线索。因此，RNA中改性碱的鉴定和表征可能导致更好地了解生物途径。

MERIP测欧宝体育官网网址序工作流程

CD基因组学通过用M6A特异性抗体进行免疫沉淀的M6A映射方法，其次是NGS（MERIP-SEQ）。将聚（a）选择的RNA分离成100核苷酸长寡核苷酸（输入），并使用抗M6A亲和纯化的抗体免疫沉淀，然后进行Illumina下一代测序。欧宝体育官网网址因为免疫沉淀的RNA片段可以沿其长度含有M6A，所以含有多个不同的M6A片段产生重叠读数。通过使用峰值检测算法以及搜索在最高读取覆盖范围附近的DRACH图案子集的存在，通过使用峰值检测算法来预测M6A站点。

图。1 MERIP测序协议欧宝体育官网网址

服务规格

	样本要求 需要至少50μg的总RNA。rin值≥7.0 细胞，组织样品被接受
	欧宝体育官网网址 灵活的服务选项包括Hiseq 4000.那Hiseq x Ten.和nextseq 500.
	生物信息学分析 鉴定RNA中的M6A残基 沿转录物的M6a峰的分布 差分峰值分析

可交付成果

• 原始排序数据欧宝体育官网网址
• 实验结果
• 数据分析报告
• 您的写作的MERIP测序中的详细信欧宝体育官网网址息（自定义）

CD基因组学的使用量序列会议侧重于组织和欧宝体育官网网址器官功能的细胞变异之间的链接，进一步阐明了疾病的起源。如果您有其他要求或问题，请随时与我们联系。

参考
多米利西替尼斯州，等。由M6A-SEQ透露的人和小鼠M6A RNA甲基甲基瘤的拓扑。自然，2012年4月29日;485（7397）：201-6。