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双RNA-SEQ

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物种之间存在广泛的相互作用,例如寄生,共生,竞争等。传统的转录组测序只能研究单一物种的信息,这不仅浪费了部分数据,而且还影响了样本本身欧宝体育官网网址两个物种的分离。

已经显示双RNA-SEQ以同时监测两种宿主和病原体的所有类别编码和非编码转录物。CD基因组学提供了高分辨率,实惠且直接的双RNA-SEQ服务,以提供直接洞察Host-Gatorogen的相互作用。

通过仅构建一个转录组文库,双RRNA耗尽或聚(a)捕获后的总混合RNA的双RNA-SEQ允许在不需要分离物种的情况下同时测序和分析两种(或更多种)物种,从而揭示欧宝体育官网网址它们之间基因表达的动态变化。同时,通过相互作用模型图,以获得基因的调节关系和两个物种之间的相互作用机制;调查在相互作用过程中的监管网络,病原体感染的机制和对疾病的宿主抗性;并探讨不同物种病原体的进化关系,进一步探讨了基于同源基因的相关基因的阳性选择。

CD基因组学可以应对各种侵袭模型 - 涉及细菌,真菌,原生动物等的病原体,宿主可能是哺乳动物或植物。我们旨在提供从实验设计的全面的双RNA-SEQ服务,以便进行生物动动分析,以支持您的研究需求。

关键优势和特点

  • 可用于各种入侵模型
  • 样品类型的灵活性:总混合RNA,受感染的宿主细胞等
  • UMI技术允许少量输入模板

双RNA-SEQ工作流程

双RNA-SEQ
双RNA-SEQ数据分析的通用管道V. Arluison等人的图。,2018年的)

双RNA-SEQ

参考:

  1. Alexander J. Westermann等,双RNA-SEQ揭示了在宿主 - 病原体相互作用中的非分量RNA功能。自然。2016年,卷。000。
  2. Alexander J. Westermann等,通过双RNA-SEQ解决宿主病原体相互作用。PLOS PAROGOG.。2017,13(2)。
  3. Véronique亚勒莫里斯和Claudio Valverde(EDS),细菌调节RNA:方法和方案。分子生物学的方法。2018年,卷。1737。
  4. Pisu等人。,Dual RNA-SEQ的MTB感染巨噬细胞体内揭示了本地性不同的宿主 - 病原体相互作用。细胞报告。2020年,卷。30。
*仅供研究使用。不用于诊断过程。
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