全长转录物测序（ISO-SEQ）欧宝体育官网网址

CD基因组学通过在没有装配的情况下生产全长成绩单，提供了广泛的经验。执行后，执行严格的质量控制，以确保全面和准确的结果。

的简介ISO-SEQ.

在真核生物中，单个基因可以在替代的剪接之后编码令人惊讶的蛋白质数，每个蛋白质具有不同的生物学功能。已知的人基因具有非常不同的功能，这取决于剪接变体的表达方式。具有替代拼接，对基因组功能至关重要。

短读RNA-SEQ通过物理剪切转录成型成型成型成碎片并重新组装，留下误操作或不完全捕获来自感兴趣基因的单一多样性的可能性。捕获全长成绩单很重要。通过利用PACBIO SMRT LONG读取测序欧宝体育官网网址技术，同种型测序（ISO-SEQ）可以容易地覆盖欧宝体育官网网址从5'端到3'-聚尾部的完整转录物，而不需要碎片化以获得全长cDNA序列，这对于识别新的转录物和新的内含子，从而精确地识别同种型，替代剪接位点，融合基因表达和等位基因表达。

与Illumina平台相比，PACBIO分析可以容易地检测非常长的多函数RNA分子（称为复杂的转录物），并揭示了并联位于位于位于位于相邻的和远处基因之间的各种新的转录重叠。提高研究基因表达和复制的基因组网络的可能性是有帮助的。

项目工作流程

样品要求：

• RNA量：总RNA≥5ug（不降解或DNA污染）
• RNA纯度：OD260 / 280 = 1.8〜2.2;OD260 /230≥1.5
• RNA质量：28秒：18s≥1.5，rin≥7

欧宝体育官网网址测序策略：

PACBIO平台，图书馆类型> 4K，6〜10克/ /每个样品

数据分析

转录组没有参考
标准数据分析

• 全长同种型分析，包括全长同种型校正，分类，减少冗余
• 转录组注释，包括基因本体，Kegg途径，Kog或Cog，Swissport
• 基因结构分析，包括替代剪接，LNCRNA，SSR，CD

高级数据分析

• 地图参考
• 基因表达水平分析
• 差异表达基因分析
• 差异表达转录的转录浓缩浓缩分析
• 差异表达基因热图
• ......（根据要求）

转录组参考
标准数据分析

• 全长同种型分析，包括参考基因组映射，全长同种型校正，分类，减少冗余
• 转录组注释，包括基因本体，Kegg途径，Kog或Cog，Swissport
• 基因结构分析，包括替代剪接，LNCRNA，SSR，CD，新型转录组预测，鉴定融合基因

高级数据分析

• 地图参考
• 基因表达水平分析
• 差异表达基因分析
• 差异表达转录的转录浓缩浓缩分析。
• 差异表达基因热图
• ......（根据要求）

分析管道

长读测序欧宝体育官网网址允许简单地识别可选地转录或加工转录物，多函数转录单元和其他长cDNA序列。通过专业知识和奉献精神，高级PACBIO SMRT平台和CD基因组学的服务将成为ISO-SEQ的最佳伴侣。请联系我们获取更多信息和详细报价。