靶向的RNA序列选择和序列欧宝体育官网网址的序列子集对兴趣的转录物,从而增加了一组聚焦的RNA序列的覆盖范围。这是一种准确的方法,它生成特定基因组区域的基因组和基因表达信息。特定的RNA序列分析可以实现
RNA-seq具有高灵敏度和对NGS的具有成本效益的机会。通过靶向捕获富集或基于扩增子的方法,靶向的RNA-seq同时衡量数十个目标。富集测定也是识别许多样本类型中已知和新型基因融合伙伴的工具。提供定性和定量信息,以进行差异表达分析,等位基因特异性表达测量以及基因融合验证,靶向RNA序列可以帮助了解肿瘤分类和进展,遗传疾病和RNA药物反应。欧宝体育官网网址癌症转录组测序提供了有关肿瘤中基因表达变化欧宝体育官网网址的宝贵信息。分析基于RNA的药物反应生物标志物有助于发现多种可触及的药物敏感的肿瘤途径,并提高药物开发过程的效率和成功率。
靶向RNA测序的优点欧宝体育官网网址
- 提供对特定成绩单的全面分析
- 选择经过验证的途径,细胞或疾病特异性面板
- 与低质量,福尔马林固定,石蜡装饰(FFPE)兼容
- 快速周转时间和最高数据质量
- 关于RNA成绩单的链信息
- 有效的转录组和途径分析
目标RNA测序工作流程欧宝体育官网网址我们提供了综合的目标RNA-SEQ工作流,这些工作流简化了整个过程,从图书馆的准备到数据分析和生物学解释。
样本要求
- 建议的浓度应为20ug/ul或更多。
- 至少需要2μg总数。
- A260:A280值应在1.8和2.0之间
- RNA应存储在无核酸酶的水或RNA稳定中。
- 必须使用诸如生物分析仪RNA芯片之类的测定法对RNA进行验证。RIN值≥7.0
- 组织,细胞,血液和血液产物是可以接受的。
欧宝体育官网网址
- Illumina高通量序列
- 灵活的服务选项:单端或配对的测序,根据研究目标可选的读数。欧宝体育官网网址
数据分析
- 原始数据QC
- 对准和基于TPM/RPKM/FPKM的定量
- 表达分析
- SNP/Indels的统计数据
- 替代剪接分析
- 去kegg注释
*仅用于研究。不用于诊断过程。