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读取的Metagenomic测序欧宝体育官网网址

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CD基因组学进一步优化了超过PACBIO在输出和读取长度的基准的过程,以支持长读取的METAGENOMIC测序,并减少一些拼接误差并有效地改善微生物群落分析的分辨率。欧宝体育官网网址

的简介读取的Metagenomic测序欧宝体育官网网址

梅泰群系定义为环境样品内含有的基因组的直接遗传分析。该领域最初从环境DNA的克隆开始,然后用功能性表达筛选,然后通过环境DNA的测序快速互补。欧宝体育官网网址

微生物样品从几乎无处不在。实例包括在健康和患病状态,土壤样品,植物根,海洋环境,废水处理厂,城市地区等人体内和人体内的微环境。

在Metagenomic实验中,测序从环境中分离的总基因组DNA。它允许研究人员识别所拥有的基因,并且这些微生物社区的代谢过程包括在环境中的不持续生物。

虽然不能隔离和培养或克隆许多天然微生物,但在样品制备和测序中错过了一些微生物生物多样性。欧宝体育官网网址现在,CD基因组学通过无培养方法为PACBIO SMRT系统提供长读的Metagenomics测序欧宝体育官网网址服务,可以平行序列数千种生物,并减少一些拼接误差并有效改善微生物群落识别的分辨率。长读的Metagenomics测序还有助于研究欧宝体育官网网址对微生物组的功能和途径面产生新的见解,试图理解和阐明微生物和其栖息地/宿主之间的关系。

数据分析基于最高质量的单分子CCS读数,无需组装进行物种级分类,功能洞察力和途径富集研究,可以恢复环境中微生物群落的信息。长读取的Metagenomics测序是获得具有欧宝体育官网网址最高精度和可靠性的微生物基因组的强大方法。

主要特点和优点

  • 最长的平均读取长度,〜50%的读数超过50kb,超过平均细菌基因组中的重复元素的大小。
  • 没有DNA扩增。
  • 最高的共识准确性,低序序列偏差欧宝体育官网网址
  • 新型生物信息学分析计划和管道
  • 经验丰富的人员

项目工作流程

样品要求:gdna≥5ug

欧宝体育官网网址测序策略:Pacbio平台,20 k图书馆

数据分析

  • 基因预测
  • 非冗余基因目录
  • 功能注释:Kegg,Eggnog,Cazy。
  • 分类管理注释
  • 途径,热爱,PCA,聚类。
  • ......(根据要求)

分析管道

PacBio系统非常强大,经济效益,应该是选择的平台Metagenomics测欧宝体育官网网址序,特别是复杂样品和低多样性微生物群落。CD基因组学将是您在长读成群测序中的最佳伴侣。欧宝体育官网网址请联系我们获取更多信息和详细报价。

*仅供研究使用。不用于诊断过程。
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