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牡丹(P. ostii)种子转录组和蛋白质组数据的综合分析揭示了与油脂生物合成和脂肪酸代谢相关的关键发育阶段和候选基因

书签和分享

2019年10月1日

王小静,梁海英,郭大龙,郭丽丽,段祥光,贾奇士,侯小盖

园艺研究6卷条款编号:111 (2019)

牡丹(P. ostii)种子转录组和蛋白质组数据的综合分析揭示了与油脂生物合成和脂肪酸代谢相关的关键发育阶段和候选基因

摘要

牡丹(芍药节牡丹DC.)的种子是一个很好的来源有益的天然化合物,促进健康,他们含有高水平的α -亚麻酸(ALA)。近年来,牡丹已成为油料作物。因此,本研究以牡丹(P. ostii)种子授粉后25、32、39、53、67、81、88、95和109 d的转录组和蛋白质组为研究对象,对其种子发育和油脂生物合成的转录和翻译调控进行了综合分析。共鉴定出38482个unigenes和2841个蛋白。将26912个差异表达基因(DEGs)和592个差异表达蛋白(DEPs)聚类为3组,分别对应于种子发育的快速生长阶段、种子内含物富集和转化阶段以及种子发育的后期脱水和成熟阶段。在转录组和蛋白质组水平上鉴定了15条脂代谢途径。途径富集分析表明,53-88 DAP发生了一段脂肪酸快速合成时期。共鉴定出与脂肪酸代谢途径相关的211个基因和35个蛋白,与不饱和脂肪酸生物合成相关的63个基因和11个蛋白,与ALA代谢相关的115个基因和24个蛋白。系统发育分析显示,16个脂肪酸去饱和酶(FAD)编码基因聚类为4个FAD组,其中8个在53 DAP表达量最高,表明它们在ALA积累中起重要作用。RT-qPCR分析表明,油脂生物合成基因的时间表达模式与RNA-seq结果基本一致。 The expression patterns of fatty acid metabolism- and seed development-related proteins determined by MRM were also highly consistent with the results obtained in the proteomic analysis. Correlation analysis indicated significant differences in the number and abundance of DEGs and DEPs but a high level of consistency in expression patterns and metabolic pathways. The results of the present study represent the first combined transcriptomic and proteomic analysis of tree peony seeds and provide insight into tree peony seed development and oil accumulation.

更多信息:https://www.nature.com/articles/s41438-019-0194-7

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