2019年11月1日
Xi Wang, Xintian You, Julian D. Langer, Jingyi Hou, Fiona Rupprecht, Irena Vlatkovic, Claudia Quedenau, Georgi Tushev, Irina Epstein, Bernhard Schaefke, Wei Sun, Liang Fang, Guipeng Li, Yuhui Hu, Erin M. Schuman & Wei陈
自然通讯第10卷，，，，文章编号：5009（2019）
混合测序工作流的流程图，包括由PACBIO测序和Illum欧宝体育官网网址ina测序组成的实验程序（蓝色矩形），以及基于Illumina的PACBIO误差校正的计算成分（粉红色矩形），然后进行全长转录组重建，转录，转录，转录，转录，转录，转录。结束验证和同工型多样性表征
抽象的
基因注释是基因组学研究中的关键资源。已经开发出许多计算方法来基于高通量短阅读测序的转录组来组装转录组，但是，仅准确性有限。欧宝体育官网网址在这里，我们将下一代和第三代测序结合起来，以重建大鼠海马中的全长转录组，该转录组通过独立的5´和3´-End欧宝体育官网网址分析方法进一步验证。我们总共检测到28,268个全长转录本（FLT），覆盖了6,380个RefSeq基因和849个未经注销的基因座。基于这些FLT，我们发现了共发生的替代RNA处理事件。与多型分析和核糖体足迹数据集成，我们预测了同工型特异性的翻译状态，并重建一个开放阅读框（ORF）-Eome。值得注意的是，高比例的预测ORF通过基于质谱的蛋白质组学验证。此外，我们鉴定神经元中具有亚细胞定位模式的同工型。总体而言，我们的数据可以提高我们对大鼠大脑中RNA和蛋白质同工型多样性的了解，并为功能研究提供丰富的资源。
