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遗传连锁图谱:定义、技术和应用欧宝官网app苹果下载

遗传连锁和连锁图谱介绍

在有性生殖的减数分裂阶段,染色体上靠近的DNA序列倾向于一起遗传。当两个遗传标记在物理上彼此接近时,它们在染色体交叉过程中不太可能分离到不同的染色单体上,因此被认为比相距很远的标记联系更紧密。换句话说,一条染色体上的两个基因越接近,它们重组的可能性就越小,而它们一起遗传的可能性就越大。不同的染色体标记完全不相关。

一个遗传连锁图描述一个物种或实验种群的已知基因或遗传标记的位置,根据重组频率,而不是每条染色体上的特定物理距离。连锁图是一种显示在同源染色体交叉过程中标记重组频率的图表。两个遗传标记之间发生的重组(分离)越多,它们之间的距离就越远。相反,标记之间的物理距离越小,它们之间的重组频率越小。以前,从编码DNA序列派生的可区分的表型(酶的产生,眼睛的颜色)被用作标记;最终,微卫星等非编码DNA序列或产生限制性片段长度多态性(RFLPs)的序列被利用。

研究人员可以使用链接图来发现其他标记,如基因,通过测试之前识别的标记之间的遗传链接。这些数据被用于在开发连锁图谱的早期阶段组装连锁组,即已知有连锁关系的基因组。随着知识的进步,可以将更多的标记合并到一个组中,直到该组包含了整个染色体。

遗传连锁图谱:定义、技术和应用欧宝官网app苹果下载图1所示。(a)物理连锁图和(b, c)遗传连锁图。(赵,2015)

用于基因组定位的技术

荧光原位杂交(FISH)

这项技术是观察染色体上基因最直接的方法。基因部分的互补序列是该基因的DNA探针。荧光染料通常用于标记。

数量性状位点(QTL)定位

就QTL的数量、基因组位置、作用和相互作用而言,QTL定位是一组数量性状在各基因组区域的基因型与表型之间关系的全基因组推断。

辅助基因组组装

组装基因组序列有两种方法:定位组装和从头组装。如果基因组已经测序,且存在参考基因组序列,则首先将新获得的重测序reads与参考基因组对齐,然后按正确顺序组装;这种装配模式被称为“映射和装配”。

欧宝官网app苹果下载基因组图谱的应用

性状相关基因的识别是基因定位/基因组定位/遗传定位的重要应用之一。欧宝官网app苹果下载

分子标记辅助育种

标记辅助育种是一种在植物和动物中选择可供农民和消费者使用的优良品质的技术。它不使用转基因技术,而是使用传统的育种方法。

比较基因组研究

比较基因组学是生物学的一个分支,研究人员使用各种工具比较不同物种的完整基因组序列。研究人员可以通过比较不同生物的特征来确定相似和不同的地方。基因定位在现代遗传学中最重要的应用之一是识别人类基因欧宝官网app苹果下载组中的致病基因。类似癌症的致病基因,包括遗传的和非遗传的,都可以被绘制出来。

引用:

  1. Chao S, Elias E, Benscher D,.利用重组替代系对四倍体小麦2B染色体上主要效应种子休眠数量性状位点的遗传定位。作物科学.2016年1月;56(1)。
  2. 遗传作图与操作:第一章简介与基础。WormBook。2006年2月17日,17岁。
*只供研究用途。不用于诊断程序。
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