绝对定量16S / 18S /其扩增子测序欧宝体育官网网址

16S rRNA基因测序通常欧宝体育官网网址用于综合生物混合物中微生物的鉴定，分类和定量。简而言之，通过PCR扩增原核生物中16S rDNA的高变区域。然后在高吞吐量排序平台上测序扩增子。欧宝体育官网网址进行这些独特的高变区域的数据分析，以确定社区中每个分类群的相对丰度，并比较感兴趣组之间的分类分析。这种分析水平可以帮助通过时间或治疗组之间或治疗组之间解决整体微生物概况的变化。因此，该方法在研究复杂环境样品中的微生物体的组成和动态变化方面起着至关重要的作用。

最近，特定环境样本中某一组微生物的绝对量化问题引起了越来越多的关注。过去，通过特定物种的绝对量化来检测它，但QPCR的结果通常是不稳定的，并且需要设计特定物种QPCR的特异性引物，并且需要更高的引物特异性。目前，一般16S rRNA测序方法只能通过特定OTU的序列数与序列欧宝体育官网网址总数的比率获得相对丰度数据。

CD基因组学基于16S外标序列可以提供微生物定量扩增子测序，以获得样品中物种的绝对丰度数据。欧宝体育官网网址通过向样本DNA添加已知拷贝数的合成序列来构建和测序16S扩增子库，然后根据外标序列的扩增子数和绝对拷贝数绘制标准曲线。最后计算样品中OTU代表序列的相应物种的16S rRNA基因的绝对拷贝数。

主要特点和优点

• ≥150,000读/样品;能够识别环境群落样本中新型微生物和新基因的能力
• 成本效益
• 没有样本偏差的高精度
• 可靠和准确的结果
• 多个应用程序欧宝官网app苹果下载

项目工作流程

服务规格

	样本要求 样品类型：常规土壤样品和粪便样品，需要评估其他样品类型 土壤≥5克;大便≥2克 GDNA量：> 500ng; gdNA浓度≥20ng/μl
	欧宝体育官网网址测序策略 推荐区域：V3 / V4 / V3 + V4 / V4 + V5 MISEQ PE250 / PE300或HISEQ PE150 ≥15W每个样本读数
	生物信息学分析 过滤 欧宝体育官网网址测序数据QC 读取组装，获取唯一标签 OTU生成和统计分析 OTU定量 物种成分分析 alpha多样性分析 β多样性分析 多样性统计数据 ...... 高级生物信息： 元分析 多OMICS集成 聚类算法 ......

在CD基因组学中，在该地区拥有多个专家和多年的经验，我们为您提供高质量的数据和集成的生物信息学分析。如果您对CD基因组学可以使用微生物量化扩增子测序感兴趣，请随时与我们联系。欧宝体育官网网址我们非常乐意得到帮助！