作为NGS服务的领先提供商，CD基因组学提供了甲基化测序服务的综合组合。欧宝体育官网网址全基因组亚硫酸氢盐测序（WGBs）是一种有效且欧宝体育官网网址可靠的策略，用于在基因组范围内鉴定单独甲基化胞嘧啶。拥有超过10年的经验和最先进的下一代测序平台，我们可以完全满足您的项目要求和预算，以探索甲虫。欧宝体育官网网址
全基因组亚硫酸氢盐测序的引入欧宝体育官网网址
在哺乳动物中，5-甲基胞嘧啶涉及甲基的共价附着于胞嘧啶的5'碳位置，赋予了信号传导和调节功能的额外能力。作为主要的表观遗传修饰之一，5-甲基胞嘧啶在许多生物过程中起着重要作用，包括基因沉默，抑制转移和重复序列，基因组印记，X染色体灭活。甲基化的检测和定量对于了解基因表达和进行外膜遗传调节的其他过程至关重要。
全基因组亚硫酸氢盐测序是在最多基因组甲基化胞嘧欧宝体育官网网址啶获得综合碱基对分辨率和定量信息的金标准，允许无偏心的基因组宽DNA甲基化分析。在整个基因组亚硫酸氢盐测序过程中，基因组DNA的亚硫酸氢钠治欧宝体育官网网址疗可以将未甲基化的胞嘧啶转化为尿嘧啶，而甲基化胞嘧啶保持完整。在该步骤之后，进行PCR扩增，文库制备和下一代测序。欧宝体育官网网址最后，通过未处理和亚硫酸钠处理序列之间的比较，确定甲基化的核苷酸位点是可行的。
全基因组亚硫酸氢盐测序的优点欧宝体育官网网址
全基因组亚硫酸氢盐测序工作流程欧宝体育官网网址
我们经验丰富的专家团队和严格的质量控制后，每个程序都会确保全面和准确的结果。在高通量测序之前，用胞嘧啶亚硫酸氢盐转化处理D欧宝体育官网网址NA样品，然后在5'和3'末端标记，并通过PCR扩增引入Illumina适配器。
服务规范
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样品要求和准备
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数据分析 我们提供多种定制的生物信息学分析：
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分析管道
从尖端的下一代测序平台和丰富的经验中受益，我们保证了高质量的数据和集成的生物信息学分析。欧宝体育官网网址如果您对CD基因组学可以使用全基因组均硫酸氢盐测序感兴趣，请随时与我们联系。欧宝体育官网网址我们期待向前移动您的项目。
参考：
黄，K。和粉丝，G。（2010）。细胞分化中的DNA甲基化和重编程：新兴系统视图。再生医学，5（4），531-544。
1.全基因组亚硫酸氢盐测序适用于哪种物种？欧宝体育官网网址
对基因组亚硫酸氢盐测序进行的物种应符合以下三种条件：欧宝体育官网网址
一种。真核生物。
湾其参考基因组至少已经组装到支架水平。
C。相对完整的基因组注释。
2.全基因组均硫酸氢盐测序有哪些优点？欧宝体育官网网址
全基因组亚硫酸氢盐测序的技术使单碱基水平的基因组甲基化分析。欧宝体育官网网址WGBS的主要优点是能够评估几乎每个CPG部位的甲基化状态，涉及低CpG密度区域，包括非基因的“基因沙漠”，部分甲基化结构域和远端调节元件。此外，WGB可以揭示绝对的DNA甲基化水平和甲基化序列背景。
对于对CPG岛屿之外的地区感兴趣的研究，RRB和Medip等目标方法不适用，最适合的选择可能是WGBS。
3.全基因组均硫酸氢盐测序有哪些欧宝官网app苹果下载应用？欧宝体育官网网址
WGBS为细胞命运承诺和重编程，基因调节以及新型表观遗传标志物和疾病目标的鉴定提供了见解。
WGBS已成为一些主要的外观蛋白组联盟中的标准方法，如NIH路线图（NIH路线图映射映射联盟），编码（人类基因组中的DNA元素的综合百科全书），蓝图（解码血液中写的表观遗传签名），和IHEC（国际人体表观联盟）。
与水稻品种基因表达相关的发散DNA甲基化模式，具有对比的干旱和盐度应力反应
期刊：科学报告
影响因素：4.259
发布时间：2015年10月09日
背景
DNA甲基化在响应于环境条件的基因活性和染色质结构的调节中起着重要作用。对基因组DNA甲基化的理解提供了对非生物应激响应/适应的调节机制的见解。
材料：三米（奥雅·萨蒂瓦）品种，IR64（干旱和盐度敏感），Pokkali（盐度）和Nagina 22（耐旱）。
结果
研究人员研究了DNA甲基化模式，DMRS（差异甲基化区域）和基因表达中的三种品种之间的差异，并进一步询问到潜在的相关性。
差分甲基化与不同品种中的差异基因表达偶联。
与所有基因相比，近端至高甲基化DMR的基因显示出较低水平的转录物丰度（下调）。近端至低甲基化DMR的基因相对于整个基因组表现出类似或中等更高的转录物丰度（上调）。DNA甲基化似乎与基因表达的ON / OFF状态相关，用于DMRS（N22 / IR64的14.5％，PK / IR64的7.2％）。
差分甲基化与蛋白质编码基因转录物丰度的关系。
2.与应力反应相关的基因的差异甲基化和基因表达的表观遗传调节。
N22 / IR64和PK / IR64中水稻基因的差分甲基化水平和相应的差异基因表达如下所示。（a）下面。N22 / IR64和PK / IR64中DMR相关基因的GO分析显示出参与应激反应的基因的显着富集。
差分甲基化，转录物丰度并富集蛋白质原因。
3. TES的甲基化状态与近端蛋白质编码基因的转录相关。
与N22 / IR64（P值1.49E-05）和PK / IR64（P值5.26E-05）（a）的非参加的非参数相比，TES的富集对于DMR相关的DEG的富集基本上高。与PK / IR64（B）的蛋白质编码基因相比，DMRs的甲基化水平的显着较高差异与TES相关。
特斯差异表达与频率/甲基化水平的相关性。
讨论
结果表明，栽培品种特异性DNA甲基化模式的潜在作用是通过调节应激响应基因表达来感测和应对应力条件的关键调节机制。该研究表明，水稻种质中的干旱或盐度耐受性依赖于DNA甲基化的程度和模式。并且证据表明，DNA甲基化通过在大多数通过近端TES的甲基化或去甲基化的甲基化或去甲基化来调节水稻中的一种浓度响应基因的表达来发挥非生物应激反应的重要组成部分。
参考：
Garg R，Chevala V V S N，Shankar R等人。具有对比度干旱和盐度应力响应的水稻品种基因表达的发散DNA甲基化模式[J]。科学报告，2015,5。
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