BSA简介
BSA,批量杀菌分析,是一种用于识别影响感兴趣特征的基因组基因座的QTL映射技术。该技术涉及形成两组通过在极其相反的表型中的个体交叉,或者感兴趣的突变体与野生型交叉,然后通过从表型分布的尾部选择个体,然后选择池测序,然后等位基因频率来产生两个块欧宝体育官网网址估计两种散发,如果含有因果区的基因组区域,两颗块之间会展出差异。
BSA概述
关键优势和特点
常用方法
- QTL-SEQ:自然突变基因的映射
- mutmap:人工突变基因的映射
BSA工作流程:
服务规格
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样本要求
- 样品类型:两个极端表型父母或野生型表型父母,极端表型后代混合池至少有20个
- DNA样品:〜1.5μg(浓度≥30ng/μl; od260/280= 1.8〜2.0)
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- 父母池20x,后代池30x
- 测序质量指标分析欧宝体育官网网址
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生物信息学分析 我们提供定制的生物信息学分析,包括:
- 原始数据QC.
- 参考对齐方式
- SNP,Indel,SV检测和注释
- 等位基因频率分析
- 兴趣特质的位置映射
- 候选基因的功能诠释
送货
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参考:
- Magwene PM,等人。使用下一代测序批量分离分析的统计。欧宝体育官网网址PLOS计算BIOL.2011,7(11):E1002255。