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批量杀菌分析(BSA)
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批量杀菌分析(BSA)

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BSA简介

BSA,批量杀菌分析,是一种用于识别影响感兴趣特征的基因组基因座的QTL映射技术。该技术涉及形成两组通过在极其相反的表型中的个体交叉,或者感兴趣的突变体与野生型交叉,然后通过从表型分布的尾部选择个体,然后选择池测序,然后等位基因频率来产生两个块欧宝体育官网网址估计两种散发,如果含有因果区的基因组区域,两颗块之间会展出差异。

BSA概述

批量杀菌分析概述(BSA)

关键优势和特点

  • 简短的实验期
  • 准确映射结果
  • 成本效益

常用方法

  • QTL-SEQ:自然突变基因的映射
  • mutmap:人工突变基因的映射

BSA工作流程:

批量分析分析(BSA)工作流程

服务规格

样本要求

  • 样品类型:两个极端表型父母或野生型表型父母,极端表型后代混合池至少有20个
  • DNA样品:〜1.5μg(浓度≥30ng/μl; od260/280= 1.8〜2.0)
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  • Illumina Hiseq平台
  • 父母池20x,后代池30x
  • 测序质量指标分析欧宝体育官网网址
生物信息学分析
我们提供定制的生物信息学分析,包括:

  • 原始数据QC.
  • 参考对齐方式
  • SNP,Indel,SV检测和注释
  • 等位基因频率分析
  • 兴趣特质的位置映射
  • 候选基因的功能诠释

送货

  • 原始数据(FASTQ)
  • 数据分析报告

参考:

  1. Magwene PM,等人。使用下一代测序批量分离分析的统计。欧宝体育官网网址PLOS计算BIOL.2011,7(11):E1002255。
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