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单细胞DNA甲基化测序欧宝体育官网网址

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CD基因组学提供单细胞DNA甲基化分析,以了解基因组5-甲基胞嘧啶(5MC)图案的异质性。

引入单细胞DNA甲基化测序欧宝体育官网网址

DNA甲基化被认为是基因表达的正常发育和调节的主要贡献者。对于维持蜂窝标识至关重要,并且与许多关键过程相关,包括基因组印记,X染色体灭活,转移元素的抑制,老化和致癌作用。目前的研究DNA甲基化的方法仅通过散装方法,例如全基因组亚硫酸氢盐测序(WGBS)欧宝体育官网网址降低表示亚硫酸氢盐测序(RRB)欧宝体育官网网址, 和MEDIP测欧宝体育官网网址序。我们将高度创新的单细胞WGBS库制备和Illumina下一代测序技术结合在单细胞分辨率下可视化基因组甲基化状态。欧宝体育官网网址单细胞全基因组二硫酸氢盐测序能够发现通常通过标准甲基化测序掩蔽的细胞异欧宝体育官网网址质性。我们为制作WGBS库提供简化的工作流程。在初始亚硫酸氢盐处理步骤中随后是WGBS文库制剂的输入DNA随机碎片。该程序可容纳超低DNA输入,使其适用于珍贵,有限,富含靶向样品的甲基化分析。

单细胞DNA甲基化测序工作流程欧宝体育官网网址

对于WGBS后硫酸铝矿图书馆准备,工作流程可以在几个小时内完成。下面概述了单细胞甲基化测序的一般工作流程。欧宝体育官网网址

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服务规格

样本要求

  • 建议为此程序推荐96孔活细胞悬浮液。
  • 特异性冷冻裂解物中的冷冻细胞也可用作原料。
  • > 100pg提取的DNA应没有酶抑制剂,可以悬浮在水中,TE或低盐缓冲液中。
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灵活的服务选项包括Hiseq x Ten.Hiseq 4000.

生物信息学分析

  • 对准参考基因组
  • 序列深度和覆盖分析
  • MC呼叫
  • 甲基化水平分析
  • 甲基姆的全球趋势
  • 甲基化密度分析
  • 差异甲基化区域(DMRS)分析
  • DMR注释和富集分析(GO / KEGG)
  • 聚类分析

可交付成果

  • 原始排序数据欧宝体育官网网址
  • 实验结果
  • 数据分析报告
  • 用于您的写作单细胞测序中的详细信息(定制)欧宝体育官网网址

CD基因组学的单细胞测序会议侧重于组织和器官功能的细欧宝体育官网网址胞变异之间的链接,进一步阐明了疾病的起源。如果您有其他要求或问题,请随时与我们联系。

参考
格拉纳,S。单细胞基因组宽亚硫酸氢盐测序揭示小鼠肝脏甲膜中的广泛异质性。欧宝体育官网网址基因组生物学,2016年17(1):150。

*仅供研究使用。不用于诊断过程。
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