rip-seq的引入
从出生(聚合酶)降解(核酸酶)的每次转录生命周期的活动涉及蛋白质结合。除了蛋白质生产外,这些转录物的子集在其他基本过程中起重要作用,例如通过转座子沉默的表观遗传调控和基因组保护。大多数研究都集中在转录组科分析上。然而,据信MRNA的水平并不总是与稳态蛋白质水平直接相关。在细胞上下文中鉴定与RNA结合蛋白(RBP)相关的RNA的兴趣日益增长,因为转发后发生的RNA处理和翻译事件的作用是值得注意的。
RIP-SEQ将蛋白质与RNA蛋白质复合物内的RNA结合的位点。RNA免疫沉淀(RIP)意味着通过使用蛋白质特异性抗体来映射利息的抗体来纯化土着条件中的RNA蛋白质相互作用。汇流技术的出现,耦合到各种裂欧宝体育官网网址口化学物质,使得在单一实验中能够同时检测千分之一的结合转录物(MRNA,非编码RNA或病毒RNA)。CD基因组学提供RIPED的RNA测序,以获得不仅仅是熟悉的熟欧宝体育官网网址悉过程,例如转录,剪接和翻译,还通过非编码RNA等RNA干扰和基因调节等较新的领域。
RIP-SEQ工作流程
CD基因组学适用Illumina NGS设备来序列结合的转录物,揭示RBPS的基因组相互作用。研究人员将根据细胞系或组织的特定蛋白质免疫沉淀提交由适当的RIP方法拉动的RNA。我们的RIP-SEQ服务通过数据分析提供来自样本QC的工作流程,可以快速分析和深入了解RNA。
FIG2。RIP-SEQ工作流程
服务规格
样本要求
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欧宝体育官网网址 灵活的服务选项包括Hiseq 4000.那Hiseq x Ten.和nextseq 500. |
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生物信息学分析
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可交付成果
如果您有其他要求或问题,请随时与我们联系。
参考
赵j.等。基因组 - 通过RIP-SEQ覆盖多元菌相关的RNA。分子细胞,2010年12月22日; 40(6):939-53