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5MC / 5HM欧宝体育官网网址C测序

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DNA甲基化和胞嘧啶(5MC)的5位的羟甲基化是在基因表达调节和细胞分化中起到重要作用的基本表观型改变。DNA甲基化通常抑制基因转录。相反,羟甲基化,激活基因表达或提示DNA去甲基化。通过TET甲基胞嘧啶二氧基酶的作用,DNA甲基转移酶引入的5MC基团可迭代地氧化成5-羟甲基胞嘧啶(5HMC),5-甲酰胞嘧啶(5FC)和5-羧基胞嘧啶(5CAC)。5HMC是三种5MC氧化衍生物中体内最丰富的组分,并且可以在几乎所有哺乳动物组织和细胞中鉴定。5MC和5HMC基因组范围的映射揭示了这些改变的基因组区域,这对于阐明其机制至关重要。

5MC / 5HMC:胞嘧啶甲基化循环图1.胞嘧啶甲基化循环(Ecsedi,2018)

CD基因组学是一家专注于排序技术的生物技术公司。欧宝体育官网网址利用尖端测序技术和深度生物信息学分析欧宝体育官网网址,我们协助客户采矿基因组学信息。我们的专业领域包括基因组学,转录组织,表观遗传学,人口遗传学,微生物学等许多领域。ob体育娱乐我们的高吞吐量5MC / 5HMC测序服务利用具有高效率,欧宝体育官网网址简单性和准确性的多个成熟和稳定平台,以帮助您的表观生物学研究。

CD基因组学可通过以下方法提供基因组5MC和5HMC检测:

1.基于抗体的免疫沉淀和羟甲基DNA的测序(欧宝体育官网网址HMEDIP-SEQ.)。

2.氧化亚硫酸氢盐测序(欧宝体育官网网址oxbs-seq.的)

3.全基因组亚硫酸氢盐/氧化亚硫酸氢盐测序(欧宝体育官网网址WGBS./ WGOXBS-SEQ)

4.减少代表性二硫酸氢盐氧化亚硫酸氢盐测序(欧宝体育官网网址RRB./ Rroxbs)

5MC / 5HM欧宝体育官网网址C测序工作流程

我们的长期经验和高级平台允许我们提供从项目咨询,实验设计,测序,生物信息学分析的全面的服务套餐。欧宝体育官网网址我们努力为您的项目提供最合适的计划。

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服务规格

样本要求 样本要求

  • 总DNA的起始量≥5μg(WGBS);≥3μg(RRB,Hymip)
  • 样品浓度≥50ng/μl
  • 所有DNA样品都验证纯度和数量
欧宝体育官网网址测序策略

  • Illumina,PE150
  • 超过80%的基地,≥Q30质量分数
生物信息学分析 生物信息学分析
我们提供定制生物信息学分析服务:

  • 欧宝体育官网网址测序数据质量控制
  • 对准参考基因组
  • 全基因组甲基化和羟甲基化水平分布
  • 相关分析
  • PCA分析
  • 差分甲基化分析和差分羟甲基甲基化分析
  • 使用Go / Kegg分析功能注释
  • 峰相关基因的差异表达水平分析
  • 免疫细胞片段分析
  • 峰值分析
  • 主题分析

参考
1. ecsedi s,rodríguez-arguilerajr,Hernandez-Vargas H. 5-羟甲基胞嘧啶(5HMC),或如何识别您最喜欢的细胞。表观环瘤。2018,2(1):3。
2. Kirschner K,Krueger F,Green Ar,Chandra T.氧化二硫酸氢盐测序的多路复用(OXBS-SEQ)。欧宝体育官网网址INDNA甲基化协议2018。人道出版社

*仅供研究使用。不用于诊断过程。
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