DNA甲基化和胞嘧啶(5MC)的5位的羟甲基化是在基因表达调节和细胞分化中起到重要作用的基本表观型改变。DNA甲基化通常抑制基因转录。相反,羟甲基化,激活基因表达或提示DNA去甲基化。通过TET甲基胞嘧啶二氧基酶的作用,DNA甲基转移酶引入的5MC基团可迭代地氧化成5-羟甲基胞嘧啶(5HMC),5-甲酰胞嘧啶(5FC)和5-羧基胞嘧啶(5CAC)。5HMC是三种5MC氧化衍生物中体内最丰富的组分,并且可以在几乎所有哺乳动物组织和细胞中鉴定。5MC和5HMC基因组范围的映射揭示了这些改变的基因组区域,这对于阐明其机制至关重要。
图1.胞嘧啶甲基化循环(Ecsedi,2018)
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3.全基因组亚硫酸氢盐/氧化亚硫酸氢盐测序(欧宝体育官网网址WGBS./ WGOXBS-SEQ)
4.减少代表性二硫酸氢盐氧化亚硫酸氢盐测序(欧宝体育官网网址RRB./ Rroxbs)
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参考:
1. ecsedi s,rodríguez-arguilerajr,Hernandez-Vargas H. 5-羟甲基胞嘧啶(5HMC),或如何识别您最喜欢的细胞。表观环瘤。2018,2(1):3。
2. Kirschner K,Krueger F,Green Ar,Chandra T.氧化二硫酸氢盐测序的多路复用(OXBS-SEQ)。欧宝体育官网网址INDNA甲基化协议2018。人道出版社。