HI-SSRSEQ.

介绍了Hi-Ssrseq

微卫星（短串联重复，str或简单序列重复，SSR）是广泛使用的群体遗传学中的标志物。ob体育娱乐尽管SSRS的准确和有效的基因分型构成了SSRS作为具有各种应用的有效遗传标记的基础，但SSR基因分型缺乏高吞吐量技术在许多作物中将其用作遗传靶标。欧宝官网app苹果下载单核苷酸多态性（SNP）或插入/缺失（INDEL）多态性在重复阵列中或在侧翼区域（FR）中，在重复阵列中或在侧翼区域（FR）中，通过单独的长度评估保持未检测到。此外，侧翼区域中的凹凸可能与SSR的尺寸突变不正确地混淆。

因此，对片段长度的传统评估可能导致低估遗传变异性，不准确的结果，甚至是错误的进化解释。为了克服这些误差，需要关于每个等位基因的核苷酸序列的信息。CD基因组学提供了一种称为Hi-SSRSEQ的技术，该技术将传统SSR的多路复用放大，具有高吞吐量测序。欧宝体育官网网址这种方法可以在数百个样品中基因型大量SSR基因座，其具有高精度的结果，由于高通量测序提供的实质覆盖，这也极大地降低了基因分型的成本和时间，并且样品之间的比较可以直接基于欧宝体育官网网址基本序列。

我们的目标是（a）以产生几种非模型植物物种的核苷酸序列数据，从SSR和侧翼区域（B）来记录重复区域的长度，因为以及SSR和FR，（3）内的SNP和诱导变化，以估计每个基因座的分子可接近尺寸同性化的量，并且（4）基于重复单元的数量比较不同数据集之间的遗传变异程度，片段长度和序列标识。

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• 遗传分析
• 精细映射
• 定量特质基因座（QTL）映射
• 标记辅助选择（MAS）育种

主要特点和优点

• 高吞吐量：充足的SSR基因座可以在数百种样品中进行基因分型，具有高精度的结果。
• 成本效益：测定成本明显低于大多数其他SSR基因分型平台。
• 简化的手工工作流程。
• 更准确的结果：避免低估遗传变异性，进化的进化解释错误。

项目工作流程

服务规格

	样本要求 DNA量≥50ng（单面板） DNA浓度≥20ng/μl
	欧宝体育官网网址 欧宝体育官网网址测序覆盖范围：1000x〜5000x（根据物种的染色体倍数，如二倍体1000 x;四倍体2500 x;六倍倍数5000 x） Illumina Miseq平台（2×250 BP配对）
	数据交付 原始排序数据欧宝体育官网网址 实验结果 数据分析报告

通过最先进的测序平台和与跨越CD基因组学的高欧宝体育官网网址度经验丰富的技术人员和科学家的深层合作，提供了一种高SSRSEQ技术，可以同时在许多定制的SSR基因座中进行大量数百个体，组合多路复用PCR和Illumina测序。欧宝体育官网网址如果您有其他要求或问题，请随时与我们联系。

参考

• PetraŠarhanová，西蒙Pfanzelt，Ronny Brandt，Axel Himmelbach和Frank R. Blatterner。SSR-SEQ：使用下一代测序的微卫星基因分型揭示了与传统碎片大小评分相比的多态性水平较高。欧宝体育官网网址生态和进化。2018; 8：10817-10833。
• 荆京杨，建张，瑞西汉，冯章，艾君毛，姜罗，鲍河东，慧柳，郝堂，剑南张和长龙文。目标SSR-SEQ：一种新型SSR基因型技术与黄瓜品种的遗传分析中的完美SSRS相关联。植物科学的边疆。2019年;10：1-12。