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基因组协会研究(GWAS)
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基因组协会研究(GWAS)

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基因组 - 范围协会研究(GWAS)是将每种单独的遗传多样性序列序列与靶性性状的表型数据相结合,以基于某些统计方法进行基因组 - 范围的关联分析,这可以快速获得染色体细分或基因影响目标性状的表型变异的基因座。Gwas不受参考基因组的影响,这可以快速准确地实现多个目标性状基因的有效定位。它具有“材料广泛来源,丰富的遗传变异和综合性格定位”的优势,并已广泛用于许多物种。根据不同物种和基因组的不同特征,可以通过不同的测序方法完成每个单独的序列。欧宝体育官网网址

Gwas的工作流程

基因组协会研究(GWAS)

GWA的优势

  • 全部基因组调查
  • 高分辨率,基于单个基础
  • 广泛的研究材料和丰富的变化可用

样本要求

  • 具有参考基因组≥200的天然群体;
    多个次要基因座控制特质≥500
  • 样本中没有明显的亚组差异
  • 学习表型特征的强烈遗传性
  • DNA样品:〜1.0μg(浓度≥10ng/μl; od260/280= 1.8〜2.0)
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  • WGS:基于SNP的10x /样品;30x /基于CNV的样品
  • GBS:10〜20W标签;平均8 x /标签
  • Illumina Hiseq.
  • 测序质量指标分析欧宝体育官网网址
生物信息学分析
我们提供定制的生物信息学分析,包括:

  • 原始数据QC
  • 参考对齐或组装
  • LD衰减距离分析
  • PCA,结构,血缘关系分析
  • GWAS分析
  • LD块分析
  • 个性化分析

送货

  • 原始数据(FASTQ)
  • 重要的SNP信息
  • QQ - 情节和曼哈顿情节
  • 数据分析报告
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