CD基因组学可以帮助您分析遗传变异,以满足各种研究需求。通过利用Affymetrix和Illumina阵列平台,我们支持高吞吐量和多路复用处理,以满足不同的研究需求,以低的每个样本成本提供高质量数据。
SNP微阵列的介绍
CD基因组学提供了最先进的变体检测和SNP基因分型技术,提供了各种基因分型服务,以低的每样本成本提供高质量数据。微阵列是一种有价值的工具,使研究人员能够从发现应用到常规筛选的遗传术中探索诸如单一核苷酸多态性(SNP)和大结构变化的遗传变体。欧宝官网app苹果下载
Affymetrix和Illumina基因分型微阵列在精密医学举措,临床和翻译研究,药理学,消费者筛查和农业应用方面提供可信的性能。欧宝官网app苹果下载基于物种和SNP的选择,可以使用多种基因分型策略。
表1.我们可用的自动化SNP基因分型平台。
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平台 |
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Genetitan仪器与Axiom阵列板一起 |
- 模型生物学研究
- 农业基因分型
- Carrierscan测定
- 鼠标多样性基因分型
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GeneChip Scanner 3000 7G系统与Affymetrix Genechip一起 |
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Illumina Iscan系统与Illumina Beadchips一起 |
- GWA.
- exoonic含量研究
- 人口规模研究
- CNV和LOH.
- 农业基因分型
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SNP微阵列的优点
- 定制,灵活,可扩展;
- 高通话率(> 99%)和高精度;
- 成本效益和高吞吐量;
- 识别目标或全基因组规模的SNP;
- 除了SNP之外,还可以测量其他遗传差异,例如拷贝数变化
- 适用于生物标志物发现和验证,临床试验,GWAS,药物代理学,取证和品种歧视。
SNP MicroArray工作流程
SNP微阵列的一般工作流程如下所述。我们有三种公认的基因分型平台(表1),用于基因组或针对性识别SNP和拷贝数变化,以高通量和实惠的方式。我们经验丰富的专家团队执行质量管理,以确保有信心和无偏见的结果。
服务规格
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样本要求
- 样本来源:人,植物或动物
- 高质量的基因组DNA,碎片最小
- DNA量≥100ng(DNA浓度≥100ng/μl)
- 样品纯度:OD260 / 280 = 1.8〜2.0
- 所有DNA样品都验证了纯度和数量
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SNP基因分型
- 可以为人类,植物和动物提供各种阵列,或者可以创建自定义基因分型阵列面板以完全满足您的特定需求
- Genetitan仪器
- GeneChip扫描仪
- Illumina Iscan.
- 测定的准确性和可靠性通常高于99.5%
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生物信息学分析 我们提供定制的生物信息学分析,包括:
- SNP识别
- GWA.
- 联系地图建设
- 基因组选择
- 人口结构分析
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我们的全方位服务涵盖了完整的过程,从基因组DNA的质量控制到基因型的测定。此外,CD基因组学也可以帮助创建自己的自定义微阵列,可以根据具体的项目要求定制。如果您有其他要求或问题,请随时与我们联系。
1. Illumina和Affymetrix基因分型平台的引入。
表1. Affymetrix和Illumina基因分型解决方案。
Affymetrix基因分型解决方案 |
Affymetrix SNP微阵列将光刻和组合化学的组合应用于直接合成玻璃表面上的寡核苷酸。Affymetrix阵列可以实现非常高的密度,以适应单个芯片上数百万探头。 |
Illumina基因分型解决方案 |
Illumina独特的Beadarray技术基于3微米的二氧化硅珠,在平面二氧化硅载玻片上自动组装在微井中。每个珠子覆盖有数十万个特定寡核苷酸的副本,其充当捕获序列。测定的准确性和可靠性通常高于99.5%。 |
2.如何为我的特定需求选择最合适的基因分型平台?
基因分型策略的选择取决于种类,目的和每个样品的SNP的数量以及样品的数量。对于不同的情况,我们建议不同的基因分型技术。
- 为了基因组SNP基因分型,我们推荐Illumina Beadchips,Affymetrix Genechips或ngs.。
- 对于基因宽的SNP基因分型,例如候选地区的精细映射或单倍型,我们推荐基于NGS或基于阵列的技术。
- 对于单个SNP的分析,我们建议实时PCR测定,Sanger测序,Illumina珠芯片,Affymetrix技术或欧宝体育官网网址ngs.。
3. CD基因组学提供了什么阵列?
在CD基因组学,我们为您的SNP基因分型项目提供了现成和自定义阵列。
表2.我们可用的SNP基因分型阵列。
人类 |
动物 |
植物 |
- Infinium全球筛选阵列-24套件
- Infinium多种族阵列
- Infinium coreexome V1.1珠芯片
- Axiom Biobank基因分型610K SNP阵列
- 基因组SNP 6.0阵列(900K SNP和950K CNV)
- AXIOM™精密医学研究阵列
- Carrierscan™测定套件
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- Infinium bovinesnp50 V3.0 beadchip套件
- Infinium porcinesnp60 v2 beadchip
- Caninehd DNA分析Beadchip套件
- Axiom Buffalo 90k SNP阵列
- Axiom Chicken 580K SNP阵列
- 鼠标多样性623K SNP阵列
- Caninehd Beadchip(繁殖协会和CNV研究的高多态SNP含量)
- ovinesnp50 beadchip(用于绵羊的基因组协会研究)
- porcinesnp60 v2珠芯片(用于多种猪品种的基因组协会研究)
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- MaizeNP50 DNA分析珠芯片
- Axiom Strawberry 95k SNP阵列
- AXIOM™大豆基因分型阵列
- AXIOM™小麦饲养员的基因分型阵列
- ATSNPTILX520433 Arabidopsis Cartridge阵列
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