长扩增子分析（LAA）

基于PACBIO循环共分序列（CCS），聚合酶可以复制相同的DNA区域几次，产生高保真，长读取（> 99.9％的单分子读取精度）。使用单分子，实时（SMRT）测序和续集系统的长扩增子分析（LAA）从长扩增子产生高精度和相控的CCS。欧宝体育官网网址

图1. SMRT测序技术概述。欧宝体育官网网址（来自Simon Ardui，等，2018年的）

与短读取测序平台相比，PACBIO的长读取测序使得序列欧宝体育官网网址放大器或捕获的片段的大小从几百kB的尺寸范围直接扩展。这些长序列对于包括SNPS，CNV和其他通常不需要组件的其他结构变体的变体可视化非常有用。

CD基因组学提供专业且经济高效的LAA服务，其中测序深度从<500到10K CCSS /每个样品，以满足您的特定研究要求。欧宝体育官网网址

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• 全长16s / 18s /其基因测序欧宝体育官网网址
• 全长HLA打字
• 替代单倍型
• 德诺维靶向基因的组装
• 自定义扩增子测序欧宝体育官网网址

样本要求

• 2μg或更多的扩增子（即纯化的PCR产物），浓度为〜50ng /μl或更高，溶解在Tris-HCl缓冲液（10mM，pH8）中并在干冰包上运输。
• 我们还提供扩增子制备服务，从包括基因组DNA，细胞颗粒和组织的起始材料。

服务工作流程

生物信息学分析

对于全长16s / 18s /其基因测序：欧宝体育官网网址

• OTUS聚类和过滤
• Otus分析和物种注释
• Alpha多样性，Beta多样性，Meta分析
• 多变体统计分析

对于其他应用程序，请欧宝官网app苹果下载咨询。

参考：

1. Simon Ardui等人。（2018）单分子实时（SMRT）测序来自年龄：医疗诊断的应用和公用事业。欧宝官网app苹果下载欧宝体育官网网址核酸研究。46（5）2159-2168。
2. Joshua P. Earl等。（2018）使用Pacific Biosciences对全长16S RRNA基因测序的健康Sinonasal Microbiome的物种级细菌群落分析。欧宝体育官网网址微生物组。6。
3. henk p.j. buermans等。（2017）灵活且可扩展的全长CYP2D6长扩增子PACBIO测序。欧宝体育官网网址人类突变。38（3）310-316。