扩增子测序服务欧宝体育官网网址

扩增子测序基于NG欧宝体育官网网址S技术或PACBIO SMRT测欧宝体育官网网址序。扩增子的超深序（PCR产品）允欧宝体育官网网址许有效的变体鉴定和表征。该技术具有广泛的应用，包括欧宝官网app苹果下载16S / 18S /其基因测序欧宝体育官网网址那SNP基因分型那CRISPR测欧宝体育官网网址序，躯体/复杂的变体发现，抗体筛选测序欧宝体育官网网址那免疫力测序欧宝体育官网网址那等。

无论您是否想检测微生物社区的多样性或发现复杂样品中的稀有体细胞突变。CD基因组学可以提供专业，成本高效和高速扩增子测序服务，以满足您的项目要求。欧宝体育官网网址

主要特点和优点

• 通过超深序列提供高敏感的检测水平欧宝体育官网网址
• 通过每次反应测序数十万个扩增器来实现高覆盖率欧宝体育官网网址
• 经济高效，快速的周转时间
• 没有必要的微生物培养
• 从100 bp到10 kb的广泛的扩增子

样品类型

纯化或未纯化的PCR产物，碎裂的DNA，GDNA，限制性消化材料和质粒。

欧宝体育官网网址排序工作流程

图1测序工作欧宝体育官网网址流程。

欧宝体育官网网址测序策略CD基因组学推荐

表1.扩增子测序的策略。欧宝体育官网网址

信息分析过程

用于多样性检测

• 数据质量控制
• OTU集群
• Alpha多样性（样本复杂性分析）
• Beta多样性（多样本比较分析，PCOA / PCA / NMDS / SIMPER）
• 分析组之间的物种差异（T-Test / MetaStat / lefse）
• 分析群体群体结构差异（Anosim / MRPP / Adonis / Amova）
• 环境因素的相关分析（Spearman / Mantel Test / CCA / RDA / DBRDA / VPA）
• 网络分析
• 功能预测（Picrust / FAPROTAX / TAX4FUN / FUNGUILD）
• 高级分析（enterotype分析/贝叶斯分析）

用于变体识别

图2变形识别数据分析。

参考

1. Betge J，Kerr G，Miersch T，等。2015年结直肠癌的扩增子测序欧宝体育官网网址：冻结和福尔马林固定样品中的变体呼叫。PLO一个10：E0127146。
2. Ison Sa，Delannoy S，Bugarel M，等。2016年针对单核苷酸 - 多态性基因分型的靶向欧宝体育官网网址扩增子测序，用于附着和效应大肠杆菌O26：H11通过高通量库制备技术进行牛菌株。Appl Environ Microbiol 82：640-649。