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HLA打字

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CD基因组学基于下一代测序(NGS)技术提供了准确可靠的HLA键入服务,该技术产生明确的相位分辨的HLA测序,从而导致单个测定。欧宝体育官网网址

介绍HLA打字

HLA(人白细胞抗原)系统编码人类中的主要组织相容性复合物(MHC)蛋白。这些整体细胞膜糖蛋白负责治疗人免疫系统。有两类MHC,即MHC I类和MHC II类。HLA基因复合物位于6p21染色体的3.6mb区域上。它们是人类基因组中最多的多态基因家族,迄今为止报告了超过10,000个不同的HLA等位基因,因此在选自单个群体的群组内的个体之间可以显着差异。HLA基因对移植抑制,自身免疫性疾病,疫苗药代理学,癌症,传染病和配偶选择有着强烈含义。

HLA基因分型是对个体的HLA类I和II类基因多态性的鉴定,其对移植匹配和疾病协会研究是必不可少的。由于各种基因组区域的高多态性,明确的HLA基因分型在技术上挑战。NGS的发展改变了这种基因分型的景观。使用PCR和NGS的高分辨率HLA基因分型是独特的能够解决患者中传统HLA基因分型和Sanger测序测定的局限性。欧宝体育官网网址它可以实现钥匙HLA基因的强大,简单,高质量和高通量分析,数据可以相位为至少6位。另一个优点是确定序列问题,因为DNA模板衍生自单分子。

HLA打字

图1.染色体6中的HLA区域。

我们的优势

  • 高分辨率和100%的精度
  • 灵活的测试站点:如HLA I类(A,B,C)和HLA II类(DQB1,DQA1,DPA1,DPB1,DRB1,DRB3,DRB4,DRB5)
  • 捕获序列使能成本欧宝体育官网网址效益,快速和高吞吐量的方式
  • 严格的质量控制和丰富的实践经验
  • 示例到报告解决方案
  • 我们的HLA键入服务已广泛应用于器官移植,人口演化,基因治疗以及免疫疾病和癌症研究。

HLA键入工作流程

我们经验丰富的专家团队在每次程序后执行质量管理,以确保全面和准确的结果。我们的HLA键入工作流程如下所述,包括DNA分离,HLA基因捕获,文库制备,高通量测序和生物信息学分析。欧宝体育官网网址

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图2.我们的HLA键入的工作流程。

服务规格

样品要求和准备

  • 样品类型:全血,基因组DNA,唾液,PBMC和口拭子。
  • DNA量≥500ng(浓度≥20ng/μl; OD260 / 280 = 1.8〜2.0);EDTA抗凝血管中1-2毫升全血;脸颊粘膜的每一侧2拭子
  • 样品制备方案涵盖DNA分离,纯化,定量,QC,等等
图书馆准备和测序欧宝体育官网网址

  • HLA Region Capture:HLA Class I,II,11个基因座
  • Miseq平台,配对结束300 bp;PacBio的SMRT平台
生物信息学分析

  • 原始数据QC
  • 对齐IMGT / HLA数据库
  • Contig组装
  • HLA打字和注释
  • 相关性分析(案例/控制)

该服务仅为R&D /非诊断目的提供,并且不得用于提供患者管理决策的结果。通过我们的高级测序平台和多年的行业经欧宝体育官网网址验,我们向您保证您的高分辨率数据和全面的生物信息学分析。如果您有其他要求或问题,请随时与我们联系。

*仅供研究使用。不用于诊断过程。
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