lncrna及其疾病特异性应用欧宝官网app苹果下载

1 lncRNA概述

非编码rna (ncRNAs)被认为是基因组序列的非翻译转录本。根据功能对ncrna进行分类如图1A所示。长链非编码rna (Long non-coding RNAs, lncrna)是一种长度超过200nt的ncrna，常驻留在细胞核中，具有组织特异性。与蛋白质编码mrna相比，lncrna的种间序列保存性较差。根据lncRNA的位置，lncRNA大致分为两类:

• 基因间lncrna，包括假基因、长基因间ncrna (lincrna)和极长基因间ncrna (vlincRNAs/macroRNAs)
• 基因重叠lncrna，由内含子rna、自然反义转录物(NATs)、启动子rna等代表

关于lncRNA的起源和进化有多种理论，如基因复制和通过移动遗传元件插入产生。为了更好地理解lncRNA的生物学，人们付出了大量的努力。建立了lncRNAbd、NONCODE、LncRNADisease、lncRNAtor、ncFANs、lnCeDB、LNCipedia等多个功能lncRNA信息数据库。表1展示了常见的lncRNA信息学资源。

图1。ncrna的一个子集及其在人类非编码转录组中的比例。

新一代测序技术的应用极大地促进了lncRNAs的发现和功能分析。欧宝体育官网网址LncRNA测欧宝体育官网网址序是一种以单碱基分辨率分析全基因组lncrna的强大工具，可深入了解其分布、功能、调控网络和疾病影响。您可以查看本文LncRNA测序工作流程及数据分析欧宝体育官网网址了解更多关于lncRNA测序的细节。欧宝体育官网网址

表1。lncRNA生物信息学资源。

2 . lncrna的疾病特异性应用欧宝官网app苹果下载

新兴的研究表明，lncrna在广泛的生物过程中，以及在疾病过程的病理生理学中发挥着重要作用。而lncRNA表达的失调在恶性转化过程中具有重要的后果。除了癌症，lncrna还被发现在神经退行性疾病(如亨廷顿舞蹈病和阿尔茨海默病)、大脑发育、心血管疾病、糖尿病和其他常见病和罕见病中发挥作用。

2.1 lncrna作为生物标志物

外泌体被认为是癌症中非常有前途的生物标志物来源。lncrna已经在外泌体中被发现，并且也与TGFβ依赖性的化疗耐药途径有关。HOTAIR是一种lncRNA，与许多恶性肿瘤的发病机制有关。例如，HOTAIR可以抑制prc -2依赖基因，其过表达是转移和死亡的有力预测因子。外泌体HOTAIR表达可用于鉴别良恶性疾病，特异性为57.2%，敏感性为92.3%。但与miR-21联合使用，特异性和敏感性分别提高到73.5%和94.2%。

除了HOTAIR，还有许多其他的lncrna是很有前途的疾病生物标志物。LncRNA MALAT1是一种肿瘤标志物，在多种肿瘤中均有过表达。肝HULC在活癌、转移性肝结直肠癌和HBV中显著过表达。在前列腺肿瘤中检测到PCGEM1与增殖增加和集落形成相关。PCNCR1是另一个被描述的前列腺癌生物标志物，在染色体8q24.2上被发现。PCNCR1是一个13 kb的转录本，可以反式激活雄激素受体(AR)，在前列腺癌的进展中起重要作用。DD3在前列腺癌中也被发现高度上调，但其在前列腺癌进展中的作用尚不清楚。

2.2 lncrnas靶向治疗药物

lncrna可以在病毒等基因治疗传递系统的帮助下用作治疗药物。另一方面，lncrna可以被合成的sirna或miRNAs靶向，也可以通过与lncrna特异性相互作用的药物来达到治疗效果。lncrna靶向药物有两个显著的优势。一个是它们允许蛋白质上调/激活，这在小分子药物之前是不成功的。二是lncrna靶向药物具有较高的特异性，尤其在靶蛋白有多个密切相关的家族成员(如离子通道和蛋白激酶)的情况下，这将是有益的。

基于寡核苷酸的方法主要有两类:(i)基于反义的方法和(ii)基于催化寡核苷酸的方法。前一种方法已广泛用于破译lncrna的功能或作为一种治疗策略。后一种方法包括DNAzymes和RNAzymes。催化寡核苷酸也可以用来了解ncrna的功能。小分子可能对调节lncRNA活性有特定的作用。无偏的高通量筛选、RNA结构的计算建模以及针对RNA配体的特异性新型支架的设计等兴趣和努力极大地加速了lncRNA的小分子靶向。

结论

尽管在了解lncRNA的生物学和相关治疗应用方面取得了重大进展，但lncRNA领域仍处于起步阶段。欧宝官网app苹果下载未来lncRNA的研究可能集中在lncRNA的表达调控、其亚型组成以及发育和组织特异性方面。

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引用:

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