CD Genomics提供强大的转录组研究服务,直至高质量样本中的单细胞输入水平。
单细胞RNA测序简介欧宝体育官网网址
细胞是生命的基本单位,每个细胞都是独一无二的。揭示生物系统中复杂细胞事件的能力对于更好地理解细胞在发育或疾病进展中的作用至关重要。通过对混合细胞群体组成的样本进行单细胞分辨率的基因表达研究,可以深入了解不同细胞类型的转录组复杂性。
CD genomics为单个细胞、少数细胞和超低RNA输入的文库制备和测序提供了一流的工具。将稳健的cDNA合成技术与Illumina欧宝体育官网网址下一代测序和分析技术相结合,我们为研究细胞间转录组异质性提供了高质量的可靠数据
单细胞RNA测序工作流程欧宝体育官网网址
细胞分类/分配技术的出现,如流式细胞术和微流体技术,使得捕获单个细胞成为可能,单个细胞的DNA或RNA被放大以供检测单细胞测序欧宝体育官网网址. 单细胞RNA测序的一般工作流程概述如下。欧宝体育官网网址
技术描述
fluidigmc1单细胞mRNA工作流程。通过FluidGM C1系统,我们提供可选规模的单细胞转录组分析服务。C1能够快速可靠地捕获和处理单个细胞。集成C1单细胞mRNA-Seq工作流的步骤包括捕获细胞的流体电路(IFC),将polyA+RNA转化为全长cDNA,并对cDNA进行通用扩增。通过可定制的微流控电路,C1实现了从识别关键细胞群到生成用于转录本3′端计数、全长mRNA测序、DNA测序、表观遗传学分析、微RNA表达谱等的测序文库的无缝过渡。欧宝体育官网网址
SMART seq用于测序的超低输入RNA。欧宝体育官网网址智能技术提供完整的转录信息,能够分析转录异构体、基因融合、点突变、,等。采用该技术的试剂盒使用户能够直接从1-1000个完整细胞或超低输入总RNA进行cDNA合成,具有高重复性和GC丰富转录物的准确表达。使用该试剂盒产生的全长cDNA文库与Illumina平台兼容。
服务规范
样品需求
>100 pg提取RNA, OD260/280比值介于1.8 ~ 2.0之间 |
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欧宝体育官网网址 灵活的服务选项包括HiSeq X 10和HiSeq 4000 |
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生物信息学分析
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可交付成果
CD Genomics的单细胞测序会议聚焦于组织中细欧宝体育官网网址胞变异和器官功能之间的联系,并进一步阐明疾病的起源。如果您有其他要求或问题,请随时与我们联系。
参考文献
1.吴,基于“增大化现实”技术等.单细胞rna测序方法的定量评估。欧宝体育官网网址自然方法. 2014年1月;11(1): 41–46.
2.皮切利,S等.使用Smart-seq2从单细胞中提取全长rna序列。自然的协议. 2014年1月;9(1):171-81.