扩增子测序服务欧宝体育官网网址

扩增子测序基于NG欧宝体育官网网址S技术或PacBio SMRT测欧宝体育官网网址序. 扩增子（PCR产物）的超深测序欧宝体育官网网址允许有效的变体识别和表征。这项技术有着广泛的应用，包括欧宝官网app苹果下载16S/18S/ITS基因测序欧宝体育官网网址,单核苷酸多态性基因分型,CRISPR测欧宝体育官网网址序，体细胞/复杂变异发现，抗体筛选测序欧宝体育官网网址,免疫序列测定欧宝体育官网网址,等.

无论您是想检测微生物群落的多样性，还是想在复杂样本中发现罕见的体细胞突变。CD Genomics可以提供专业、经济高效和高速的扩增子测序服务，以满足您的项目要求。欧宝体育官网网址

主要特点和优势

• 通过超深测序提供高灵敏度检测水平欧宝体育官网网址
• 通过对每个反应数十万个扩增子进行测序实现高覆盖率欧宝体育官网网址
• 具有成本效益和快速周转时间
• 微生物培养是不必要的
• 从100 bp到10 kb的宽范围放大器

样本类型

纯化或未纯化的PCR产物、片段DNA、gDNA、限制性消化物质和质粒。

欧宝体育官网网址排序工作流

图1排序工作欧宝体育官网网址流程。

欧宝体育官网网址CD基因组学推荐的测序策略

表1。扩增子测序策略。欧宝体育官网网址

信息分析过程

用于分集检测

• 数据质量控制
• OTU聚类
• 阿尔法多样性（样本复杂性分析）
• β多样性（多样本比较分析，PCoA/PCA/NMDS/Simper）
• 组间物种差异分析（T检验/Metastat/LEfSe）
• 群体间群落结构差异分析（Anosim/MRPP/Adonis/Amova）
• 环境因素相关分析（斯皮尔曼/曼特尔试验/CCA/RDA/dbRDA/VPA）
• 网络分析
• 功能预测（PICRUSt/FAPROTAX/Tax4fun/FunGuild）
• 高级分析（肠型分析/贝叶斯分析）

用于变体识别

图2变量识别的数据分析。

工具书类

1. Betge J，Kerr G，Miersch T，等. 2015大肠癌的扩增子测序：冷欧宝体育官网网址冻和福尔马林固定样本中的变异调用。Plos One 10:e0127146。
2. 伊森·萨，德尔哈兹，布加雷尔·M，等. 2016靶向扩增子测序用于附着和脱落基因单核苷酸欧宝体育官网网址多态性分型大肠杆菌O26:H11牛品系通过高通量文库制备技术。应用环境微生物学82:640-649。