新兴的传染病有可能对人类施加巨大的死亡,发病率和经济负担。传统上,跟踪传染病的传播以帮助控制它们,这在流行病或大流行过程中收集的案例数据分析。在过去的几十年中,有几例病毒疾病暴发的病例,每种病毒的强度都取决于病毒在人类之间传播的能力。此类事件包括猪和鸟类 - 鸟类流感,埃博拉病毒和Zika等复发爆发,以及新型病毒,导致SARS,MERS和COVID-19。随着测序技术和系统发育学的进步,科学家能够欧宝体育官网网址识别和表征因果病毒,传输链跟踪和爆发映射更快,准确地映射。
Sanger测欧宝体育官网网址序
病毒基因组测序是医学诊断,欧宝体育官网网址爆发研究和宿主病原体相互作用的研究的重要方法。作为经典且高度准确(99.99%)的测序技术,欧宝体育官网网址Sanger测欧宝体育官网网址序被认为是验证特定基因序列的“黄金标准”。此外,Sanger测序也是临床分子欧宝体育官网网址诊断的标准。它可以在传染病,遗传疾病和肿瘤学领域提供大力帮助。多年来,Sanger测序技术和数据分析方法得到欧宝体育官网网址了极大的优化。因此,即使在下一代测序(N欧宝体育官网网址GS)的开花中,Sanger测序仍然是对单个基因或扩增子进行测序的有用工具。
高通量测序欧宝体育官网网址
全基因组测序欧宝体育官网网址相应的生物信息学分析是研究病毒进化,毒力因子变化,遗传变异以及用于新疗法的发展的有效和可靠的工具。NGS已成为测序病毒基因组的最受欢迎的方法,尤其是在必须同时进行许多基因,搜索新型基因变异欧宝体育官网网址和低含量样品的情况下。
在病毒学中的高通量测序方法的比较欧宝体育官网网址
方法
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优点
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缺点
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基于混合捕获的测序欧宝体育官网网址 |
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参考:
- Houldcroft CJ;等。病毒基因组测序的临床和生物学见解。欧宝体育官网网址自然评论微生物学。2017,15(3):183。
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