CD基因组学博客

探索我们开发的博客,包括基因组教育,基因组技术,基因组进展,基因组新闻和观点。

每月档案:2018年10月

为什么要进行16S rRNA测序欧宝体育官网网址

什么是16S rRNA?16S核糖体RNA(或16S rRNA)是原核核糖体30S小亚基的组成部分,大约有1500个碱基对。图1A显示了16S rRNA如何参与原核核糖体。细菌16S rRNA基因包含9个高变区(V1-V9),范围为30-100个碱基对,两侧为保守区(图1C)。你可以找到[…]

18S rRNA及其在真菌多样性分析中的应用

什么是18S rRNA?18S核糖体RNA (18S rRNA)是小真核核糖体亚基(40S)的组成部分,40S和60S构成真核核糖体。作为真核核糖体的结构RNA, 18S rRNA是原核生物和线粒体中16S rRNA的同源物,因此是所有真核细胞的重要组成部分之一。[…]

Illumina下一代测序原理和工作流程欧宝体育官网网址

Illumina公司于1998年在加州圣地亚哥成立,是测序领域的领先公司。欧宝体育官网网址2006年,Illumina收购Solexa,获得了下一代高通量测序技术,并将其发展成为市场上的主流技术。欧宝体育官网网址目前提供测序系统,如MiSeq, HiSeq欧宝体育官网网址 2500, HiSeq 3000, HiSeq 4000, HiSeq X Ten, HiSeq[…]

进化因素对肠道微生物群的影响强于饮食模式

我们都知道肠道微生物为宿主提供多种服务,包括消化。具有特殊饮食习惯的哺乳动物,如食肉动物和食蚁兽,有特殊的肠道微生物,使它们能够吃到这些食物。微生物组领域的一个共同主题是宿主饮食对其[…]有重大影响。

16S rRNA,最重要的rRNA之一

什么是16S rRNA 16S rRNA (16S核糖体RNA),是原核核糖体30S亚基的组成部分。16S中的“S”为沉降系数,即反映大分子在离心场中向下运动速度的指标。数值越高,分子越大。16S rRNA基因是[…]

微卫星基因分型的基本事实-微卫星简介

微卫星又称简单串联重复序列(simple tandem repeats, STRs),是分布在真核生物基因组中的简单重复序列,由2 ~ 6个核苷酸串联重复序列组成。由于个体的重复次数是可变的,因此微卫星标记的应用非常广泛。微卫星位点通常用PCR扩增。PCR产物经电泳分析[…]

基因组学-法医年龄鉴定

总结:一种DNA甲基化年龄推断方法,结合Sequenom MassARRAY技术,可将年龄误差降低至4.7年。年龄鉴定是法医学领域的重要课题之一。特别是对于青少年犯罪、高度腐败的尸骨和无名尸体,它可以提供范围[…]

新型结直肠癌易感基因ETV6及其常见遗传变异的发现

全基因组关联研究(Genome-wide association study, GWAS)是一种检测特定物种中不同个体间全部或大部分基因,了解不同个体间遗传变异的方法。应用GWAS方法在结直肠癌中发现了许多易感基因和位点,但仍有许多未知的易感基因[…]

CD基因组公司发布了一项名为单细胞测序的新技术欧宝体育官网网址

2016年6月7日,单细胞转录和甲基化分析已经成为单细胞研究的有力工具。然而,在单细胞中很难揭示DNA甲基化与基因表达之间的直接相关性。这是因为细胞之间存在很大的差异,我们无法检测到细胞的转录[…]

每个人都有自己的小“宇宙”

每天我们都在和无数的微生物打交道。但最新的宏基因组学研究表明,我们皮肤表面的微生物种群高度稳定。这些小家伙围绕着我们,就像一个看不见的“小宇宙”。我们皮肤上的细菌、真菌和病毒大多是无害的,甚至是健康的。但是那里[…]

Baidu