扩增子定义
在分子生物学中，扩增子代表DNA或RNA片段，其是扩增或复制事件的源和/或产物。通过基因重复，它们可以自然形成。自然基因复制在基因组进化中起着至关重要的作用。在这种情况下，扩增子是指已经在基因组的其他地方被扩增和重新插入的染色体DNA的一部分。还可以使用诸如聚合酶链反应（PCR）等方法人工产生的扩增子。在PCR实验中，扩增子是指扩增反应的产物，即PCR产物。
PCR是用于产生兴趣扩增子的最重要的方法，具有特异性，敏感性和扩增不纯DNA的特异性和能力。可以确定与凝胶电泳，毛细管电泳，Sanger测序，下一代测序（NGS），长度和DNA基础组合物的技术耦合。欧宝体育官网网址扩增子分析对于探索基因组的兴趣基因非常有用，并且已应用于各种领域，例如科学研究，取证，特别是临床诊断。
扩增子测序欧宝体育官网网址
ob电竞官网 是一种高度有针对性的技术，使得研究人员利用一系列寡核苷酸探针对靶向和捕获感兴趣的区域进行分析特定基因组区域的遗传变化，然后进行高通量测序。欧宝体育官网网址扩增子的长度范围为100bp至10kb。超深扩增子测序允许变体检测和表征。欧宝体育官网网址16S / 18S /其扩增子测序欧宝体育官网网址是扩增子测序的常见应用。欧宝体育官网网址它是一种普遍存在的微生物系统和分类研究方法。另一个应用，靶向基因测序板在诊所非常有用。欧宝体育官网网址面板含有一组基因或区域，其具有与疾病或在研究中的疾病或表型的关联。
图1.扩增子测序的工作流程。欧宝体育官网网址
扩增子测序的优点：欧宝体育官网网址
- 通过超深序列测序，实现目标区域的高敏感性检测欧宝体育官网网址
- 高覆盖范围：在一次运行中分析数百或数千个放大器
- 低成本和快速周转时间
- 不需要微生物培养物
- 允许灵活地实现各种实验设计
- 即使从难以序列的区域，也可以获得和分析扩增子，例如GC的地区
扩增子测序的前景欧宝体育官网网址
长读取测序技术，包括欧宝体育官网网址PACBIO SMRT测序和牛津纳米孔测序提供完整，均匀，非偏见的覆盖长扩增子。随着长读测序的开发和可用性，扩增子测序变得越来越高效，准确，敏感。欧宝体育官网网址长读扩增子测序提供超深，连续的扩增子测欧宝体育官网网址序，可用于增长10 kB，从而从SNPS到大型插入和删除，可以发现各种变体。此外，PACBIO循环共识测序可获得高达99.999％的单分子基础呼叫精度。欧宝体育官网网址在扩增子测序上有许多长读测序技术的应用，例欧宝官网app苹果下载如欧宝体育官网网址全长16s / 18s / stits测序欧宝体育官网网址。
参考：
- 瓦斯玛，等。医学诊断领域聚合酶链反应的原理欧宝官网app苹果下载及应用：综述。巴西微生物学杂志，2009,40（1）：1-11。
- 高米，等。下一代目标扩增子测序（NG-TAS）：用于循环肿瘤DNA的经济有效分欧宝体育官网网址析的优化方案和计算管道。基因组医学，2019,11（1）：1。
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