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什么是DNA测序?欧宝体育官网网址

DNA测欧宝体育官网网址序是确定构成DNA分子并传达重要遗传信息的四个核苷酸碱基(腺嘌呤,胸腺嘧啶,胞嘧啶和鸟嘌呤)的序列的方法。在DNA双螺旋中,四个碱基与特定合作伙伴键,以形成称为碱基对(BP)的单位。腺嘌呤(A)对具有胸腺嘧啶(T)和胞嘧啶(C)对具有鸟嘌呤(G)的对。人类基因组含有大约3亿基对,提供了人类创造和维护的指示。基于配对的结构使得DNA序列非常适合于储存大量的遗传信息。该互补碱基配对是将DNA分子复制,转录和翻译的机制的基础,并且配对也使DNA测序方法的大部分底层下潜。欧宝体育官网网址由于DNA测序技术和方法的巨大改进,全基因组测序变得可能和价格实惠。欧宝体育官网网址

DNA测欧宝体育官网网址序方法

Sanger测欧宝体育官网网址序是在20世纪70年代的英语生物化学师Frederick Sanger发现的。Sanger方法是一种经典DNA测序方法,其利用荧光DDNTPS(欧宝体育官网网址二脱氧核苷酸,N = A,T,G或C),以防止添加另一个核苷酸。您可以查看我们的文章'Sanger测欧宝体育官网网址序:介绍,原则和协议“要了解有关此方法的更多信息。

下一代测序(NGS也称为大量平行欧宝体育官网网址测序)技术主要包括桑克斯测序,其中优点是高​​吞吐量,成本效率和快速性。NGS可以同时确定数百万片碎片的顺序。NGS是一种短读测序,需要建造小片段库,欧宝体育官网网址其次是深度测序,原始数据预处理,DNA序列对准,组装,注释和下游分析。

新兴的第三代测序,也称为长读测序,包括欧宝体育官网网址PACBIO SMRT测欧宝体育官网网址序牛津纳米孔测序欧宝体育官网网址,可以检查DNA和RNA模板的数十亿模板,同时检测无偏压的可变甲基化。长读取方法可以检测更多的变化,其中一些不能单独使用短读测序观察。欧宝体育官网网址

DNA测欧宝体育官网网址序:定义,方法和应用欧宝官网app苹果下载

图1. DNA测序技术的历史。欧宝体育官网网址

欧宝官网app苹果下载DNA测序技术的应用欧宝体育官网网址

DNA测欧宝体育官网网址序揭示了在特定DNA段,全基因组或复杂微生物组中携带的遗传信息。科学家可以使用序列信息来确定DNA分子中含有哪种基因和调节指令。可以筛选DNA序列以筛选基因的特征,例如开放阅读框架(ORF)和CPG岛。可以比较来自不同生物的同源DNA序列以比较物种或群体之间的进化分析。值得注意的是,DNA测序可欧宝体育官网网址以揭示可能导致疾病的基因的变化。

DNA测欧宝体育官网网址序已用于医学,包括疾病和流行病学研究的诊断和治疗。欧宝体育官网网址测序具有彻底改变食品安全和可持续农业的能力,包括动物,植物和公共卫生,通过有效植物和动物育种改善农业,并降低疾病爆发的风险。另外,DNA测序可用于保护和改善人类欧宝体育官网网址和野生动物的自然环境。

参考:

  1. Mardis E R. DNA测欧宝体育官网网址序技术:2006-2016。自然协议,2017,12(2):213。

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