有机体生活在生态环境中，而纯文化在自然界中很少存在。微生物群落组成微生态学是一个例子，系统远非纯粹的文化，使它们在生态系统中扮演的角色是动态的。尽管微生态丰富且无处不在，但我们对微生态、它们的相互作用和功能的理解落后于我们对纯文化的了解。
在环境中，微生态维持稳定，参与宏量养分的生化循环，从而减轻环境污染。农业从中受益的方式包括作物产量的提高、动物生产力和健康状况的改善以及微生物的改善。在医学上，它阐明了致病机制，有助于人类疾病疫苗和药物的开发。人类有自己的微生态，在免疫反应和疾病进展等过程中发挥作用。这种微生态的相互作用也会产生大量的结果，这些结果要么对彼此有益，要么对彼此有害。
传统方法仍然可以使用，但通常情况下，它们可能是费力和耗时的。随着先进的分子生物学工具,类型和频率的微生物,以及质量和数量的样本,可以测量通过下一代测序,测序读,离子的PGM,纳米孔系统,克隆库,实时qPCR PCR-denaturing梯度凝胶电泳(DGGE),欧宝体育官网网址和厌氧文化。在制药领域，第三代测序、SNP基因分型和基因芯片分析也被用于鉴定和表征。欧宝体育官网网址微生物鉴定方面，16S核糖体RNA用于细菌鉴定，而18S rRNA和ITS区域是真菌鉴定的理想区域。通过短读和全长16S/18S/ITS扩增子测序，新微生物的检测成为可能。欧宝体育官网网址欧宝体育官网网址测序数据通过生物信息学平台进行比对、修剪、多样性分析、相关性分析和分类赋值。这里唯一的挑战是这种微生态的来源和收集方法的多样性。之后，过程会根据所需的输出发生偏差。
通过宏基因组在美国，在火山、深海和放射性区域发现的极端微生物可以被探索。这种独特的微生态表现出新的酶和生化途径等着被发现。从它们中收集的酶可以用于各种工业应用。欧宝官网app苹果下载空气中也有微生物多样性，这些微生物会影响空气质量，并导致过敏和感染等人类疾病。研究航空微生态学可以洞察其功能、结构和关系。包括污水在内的水体微生态学控制着水质和生物地球化学过程。研究它的多样性使我们能够创造污水处理和水污染的解决方案。另一方面，土壤微生物群参与毒素的清除、分解、植物生长和抵御病原体。
从更宏观的角度看，通过测序的微生态研究有助于我们产生创新的理想解决方案，如微生物肥料、微生物燃料电池、健康的动物、有效的益欧宝体育官网网址生菌、作物增产和废物管理的适当方案。这也可以用于个性化医学，在这种医学中，人类和周围相互作用的微生态的改变可以作为潜在疾病诊断和治疗的生物标志物。快速自动化测试也正在出现，可用于食品、化妆品和制药行业。
参考文献
- 史海林，兰艳红，胡志成，等．微生态学研究:预防哮喘的新靶点。中国医学杂志。2020、133(22)。
- 严俊，吴旭，陈杰，等．运用宏基因组学策略探索国家一级保护动物紫貂(Martes zibellina)肠道微生态。AMB表达．2020年,10(1)。
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