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微生物指纹,来自个体肠道微生物动态的健康见解

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2021年4月9日

微生物指纹,来自个体肠道微生物动态的健康见解

纽约 - 一个新的测序研究表明肠道欧宝体育官网网址微生物社区的个性化和时间相对稳定,尽管这种遗传稳定性的程度稍微随着微生物物种而变化。

来自荷兰和以色列的研究人员对从中预期荷兰人口研究队员的338名参与者进行了粪便样本的肉豆蔻测序,在四年内寻找每个人的微生欧宝体育官网网址物指纹的稳定物种,以及在时间点上不恒定的不稳定物种经过考虑的。它们的结果表明肠道微生物群落在个体内仍然相当持续,与从一个人到下一个人发现的微生物多样性差异相比。

“肠道微生物组在微生物丰富和微生物基因组中表现出一种长期的个体稳定性,”京远乐趣和亚历山德拉·哲沃瓦的共同高级和相应的作者,与格罗宁根大学的遗传学,他们的同事写道星期五发表在细胞中的一篇文章,注意到“微生物的遗传构成表明,可以用作指纹的个性,以区分属于同一个人的偏见组样本。”

尽管如此,球队指出,微生物族稳定性在属于肠道社区的虫子上并不统一。相反,可用的SNP,结构变体和其他遗传数据暗示了少量不稳定的物种 - 包括涉及人体健康和疾病过程的错误 - 随时间而不是其他肠道微生物的遗传恒定。

“我们观察到的稳定和可变的微生物成分和遗传成分可以具有不同的影响:可以使用单独稳定的微生物组分来鉴定其宿主,而可变的微生物组分可能与主体的表型变化有关,”作者提出。

通过专注于在个人内相对稳定的微生物,该团队能够将来自基准的参与者和四年之后的聚焦序列链接到大约85%的准确性。从初始队列中开发的“微生物指纹纹理”方法显示出95%的精度,用于将每年采取的样品与同一个体相比施用于人类微生物组项目的43个个体的纵向肠道微生物数据。

此类结果“展示了我们在区分样本混合中的方法的潜在应用,”作者建议,但也提高了招聘人类微生物组研究项目的受试者的隐私问题。“

当调查人员试图将肠道微生物特征系在血液血浆水平较近1,200个靶向液相色谱和质谱分析的代谢物时,同时,它们揭示了涉及数十种代谢物和相关的微生物特征或丰富的450个显着的关联。

类似的宿主表型分析突出显示169个微生物特征和近三十个相关的宿主表型 - 从体重指数和血压到抑郁症。它们在硅中介分析中的随后表明,血浆代谢物可以用作个体肠道和一些健康特征的微生物之间的桥梁。

“宿主表型和血浆代谢物中,我们的纵向微生物关联和调解分析揭示了肠道微生物组在人类健康和疾病发病中的作用的功能见解和推定因果关系,”作者结束了。

更多信息AT:https://www.genomeweb.com/sequenc欧宝体育官网网址ing/microbial-fingertrints-health-Insights-gleaned-individual-gut-microbiome-dynamics

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